125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4237 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4237  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 588 aa  1201    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000286239  hitchhiker  0.000138853 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0806  Pyrrolo-quinoline quinone  45.36 
 
 		 577 aa  437  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4243  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  33.45 
 
 		 713 aa  270  7e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.562267  normal  0.0150792 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0596  Pyrrolo-quinoline quinone  35.66 
 
 		 700 aa  259  7e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.673642 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  34.67 
 
 		 469 aa  79  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 		 795 aa  78.2  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  34.72 
 
 		 963 aa  76.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  32.43 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  27.57 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  31.38 
 
 		 475 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  31.76 
 
 		 463 aa  71.2  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  34.85 
 
 		 514 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  31.13 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.44 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.44 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.44 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.44 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  28.99 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  34.18 
 
 		 1454 aa  65.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  25.96 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.96 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.96 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.96 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.96 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.96 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  25.96 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  28.16 
 
 		 484 aa  63.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.96 
 
 		 392 aa  63.5  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.48 
 
 		 392 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1682 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.96 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  31.07 
 
 		 363 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  31.13 
 
 		 687 aa  62.4  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  31.46 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 		 392 aa  62  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  27.39 
 
 		 774 aa  60.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  31.52 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  25.9 
 
 		 653 aa  60.8  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.34 
 
 		 395 aa  60.1  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  26.26 
 
 		 861 aa  59.7  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1119  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.87 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  31.78 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 		 652 aa  58.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  35.45 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0010  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.4 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.469712  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  27.54 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  26.88 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  31.09 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  26.25 
 
 		 371 aa  57  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  27.2 
 
 		 387 aa  57  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.57 
 
 		 395 aa  57  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  29.01 
 
 		 2122 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  28.06 
 
 		 546 aa  55.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  32.26 
 
 		 445 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  25.32 
 
 		 371 aa  56.2  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.64 
 
 		 386 aa  56.2  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  30.28 
 
 		 383 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.6 
 
 		 395 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.74 
 
 		 393 aa  55.5  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  29.68 
 
 		 901 aa  55.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.6 
 
 		 395 aa  55.1  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.24 
 
 		 393 aa  54.7  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27 
 
 		 1383 aa  53.9  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  26.83 
 
 		 616 aa  53.9  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.11 
 
 		 393 aa  53.9  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  27.1 
 
 		 412 aa  53.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 		 395 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.39 
 
 		 393 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.39 
 
 		 393 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.39 
 
 		 393 aa  52.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  25.91 
 
 		 400 aa  52.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  25.91 
 
 		 400 aa  52.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  28.47 
 
 		 611 aa  52.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  23.63 
 
 		 384 aa  52  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.38 
 
 		 386 aa  52  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  30.84 
 
 		 396 aa  52  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.02 
 
 		 393 aa  52  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  29.29 
 
 		 450 aa  52  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  23.63 
 
 		 384 aa  51.6  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  23.59 
 
 		 386 aa  51.6  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.62 
 
 		 393 aa  51.6  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  25.89 
 
 		 1812 aa  51.2  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1729  Pyrrolo-quinoline quinone  26.88 
 
 		 372 aa  51.2  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  30.37 
 
 		 619 aa  50.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2451  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  26.81 
 
 		 576 aa  50.8  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  27.22 
 
 		 365 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  28.65 
 
 		 363 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  35.29 
 
 		 322 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0204  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  29.01 
 
 		 555 aa  49.7  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  21 
 
 		 1067 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2204  Pyrrolo-quinoline quinone  23.95 
 
 		 444 aa  48.5  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1875  Pyrrolo-quinoline quinone  34.58 
 
 		 381 aa  48.5  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1308  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.57 
 
 		 395 aa  48.5  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000307899  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.56 
 
 		 411 aa  48.9  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  23.72 
 
 		 705 aa  48.5  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2987  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.19 
 
 		 395 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.198648  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  24.89 
 
 		 411 aa  48.1  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2649  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.29 
 
 		 395 aa  48.1  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0884  Pyrrolo-quinoline quinone  30 
 
 		 342 aa  47.8  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0837922  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3145  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.19 
 
 		 395 aa  47.8  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0657183 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>