27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0596 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4243  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  72.79 
 
 		 713 aa  1002    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.562267  normal  0.0150792 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0596  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 700 aa  1413    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.673642 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4237  Pyrrolo-quinoline quinone  35.77 
 
 		 588 aa  259  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000286239  hitchhiker  0.000138853 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0806  Pyrrolo-quinoline quinone  33.95 
 
 		 577 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  28.71 
 
 		 276 aa  55.8  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  28.33 
 
 		 1969 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  27.49 
 
 		 371 aa  55.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  28.33 
 
 		 2036 aa  55.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  28.51 
 
 		 463 aa  52.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  28.97 
 
 		 266 aa  50.1  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  26.54 
 
 		 371 aa  49.7  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  24.71 
 
 		 475 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  28.24 
 
 		 2272 aa  48.5  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0204  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  28 
 
 		 555 aa  48.5  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  30 
 
 		 1842 aa  48.9  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  27.22 
 
 		 457 aa  47.8  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  30.39 
 
 		 795 aa  47  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  33.13 
 
 		 963 aa  47  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  24.88 
 
 		 423 aa  46.6  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  28.86 
 
 		 445 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  31.13 
 
 		 352 aa  45.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  24.04 
 
 		 432 aa  45.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  22.03 
 
 		 809 aa  45.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2878  Pyrrolo-quinoline quinone  30 
 
 		 727 aa  45.1  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  26.25 
 
 		 431 aa  44.7  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  30.56 
 
 		 469 aa  44.3  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  27.85 
 
 		 412 aa  44.3  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>