100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3154 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3153  hypothetical protein  62.46 
 
 		 637 aa  743    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0308733  normal  0.0661061 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3154  hypothetical protein  100 
 
 		 631 aa  1268    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.164464  hitchhiker  0.00920589 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  25.49 
 
 		 963 aa  74.7  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  25.32 
 
 		 454 aa  70.1  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  25.16 
 
 		 448 aa  70.1  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  25.16 
 
 		 454 aa  68.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  26.04 
 
 		 687 aa  68.2  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  24.49 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  25.19 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  20.94 
 
 		 652 aa  61.6  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  21.91 
 
 		 653 aa  60.8  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  24.44 
 
 		 475 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  22.42 
 
 		 463 aa  60.1  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  24.06 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2199  Pyrrolo-quinoline quinone  22.61 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  21.12 
 
 		 901 aa  58.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  24.67 
 
 		 774 aa  57.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  23.86 
 
 		 795 aa  57.8  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  22.29 
 
 		 1241 aa  57.4  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  21.81 
 
 		 422 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0990  Pyrrolo-quinoline quinone  22.04 
 
 		 441 aa  56.2  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1570  Pyrrolo-quinoline quinone  21.91 
 
 		 568 aa  56.2  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0635613  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  22.19 
 
 		 445 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  22.29 
 
 		 1328 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4873  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  34.33 
 
 		 587 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.0810929 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1540  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  34.33 
 
 		 587 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1339  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  34.33 
 
 		 587 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38566  normal  0.435914 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  24.92 
 
 		 432 aa  54.3  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  23.69 
 
 		 382 aa  53.9  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  23.24 
 
 		 1454 aa  53.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1595  putative alcohol dehydrogenase  24.34 
 
 		 561 aa  52.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  25.77 
 
 		 611 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  20.93 
 
 		 514 aa  52.4  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1441  Pyrrolo-quinoline quinone  24.33 
 
 		 708 aa  52.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121309 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.06 
 
 		 385 aa  51.6  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0721  Pyrrolo-quinoline quinone  30.08 
 
 		 702 aa  51.2  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760072 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  24.9 
 
 		 415 aa  50.8  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0905  alcohol dehydrogenase  26.4 
 
 		 711 aa  50.8  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.879569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2190  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.13 
 
 		 380 aa  50.4  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  21.53 
 
 		 422 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  22.77 
 
 		 387 aa  50.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4104  hypothetical protein  30.43 
 
 		 837 aa  50.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02746  polyvinylalcohol dehydrogenase  24.66 
 
 		 561 aa  49.3  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3387  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  24.53 
 
 		 601 aa  49.3  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0476  quinoprotein alcohol dehydrogenase  30.32 
 
 		 618 aa  49.7  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260666 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  23.4 
 
 		 423 aa  48.1  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2679  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  28.67 
 
 		 595 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3084  Pyrrolo-quinoline quinone  28.67 
 
 		 595 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  20.97 
 
 		 396 aa  47.8  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2497  Pyrrolo-quinoline quinone  21.21 
 
 		 475 aa  47.8  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  21.66 
 
 		 556 aa  47.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3624  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  30.08 
 
 		 579 aa  47.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214303  hitchhiker  0.00920421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2409  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  28.36 
 
 		 589 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13814  normal  0.848808 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0865  Pyrrolo-quinoline quinone  24.09 
 
 		 611 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  28.12 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1875  Pyrrolo-quinoline quinone  22.82 
 
 		 381 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1963  quinate dehydrogenase (pyrroloquinoline-quinone)  26.71 
 
 		 794 aa  47  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  28.12 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3214  Pyrrolo-quinoline quinone  20.64 
 
 		 349 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000613548  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2355  Pyrrolo-quinoline quinone  24.28 
 
 		 730 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0680369  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1314  hypothetical protein  24.59 
 
 		 380 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3312  quinoprotein alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 		 623 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2878  Pyrrolo-quinoline quinone  27.27 
 
 		 727 aa  46.2  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14910  hypothetical protein  24.59 
 
 		 380 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  24.46 
 
 		 1969 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38860  quinoprotein alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 		 623 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  23.38 
 
 		 399 aa  45.8  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  24.46 
 
 		 2036 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2674  quinoprotein ethanol dehydrogenase  27.92 
 
 		 631 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3124  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  34.83 
 
 		 595 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0497789  normal  0.831174 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  28.85 
 
 		 726 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3387  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  32.22 
 
 		 380 aa  46.2  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3089  Pyrrolo-quinoline quinone  27.92 
 
 		 631 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.326291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  20.8 
 
 		 386 aa  45.8  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3125  Pyrrolo-quinoline quinone  20.95 
 
 		 444 aa  45.8  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  25.9 
 
 		 365 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3129  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  27.92 
 
 		 631 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.957958  normal  0.28425 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5155  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  24.87 
 
 		 573 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.843195 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  27.78 
 
 		 371 aa  45.8  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4972  Pyrrolo-quinoline quinone  25.32 
 
 		 608 aa  45.8  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.779778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3242  Pyrrolo-quinoline quinone  24.87 
 
 		 573 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00434002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5126  Pyrrolo-quinoline quinone  24.87 
 
 		 573 aa  45.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1130  Pyrrolo-quinoline quinone  21.17 
 
 		 389 aa  45.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  20.68 
 
 		 363 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  24.12 
 
 		 705 aa  45.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  20 
 
 		 1812 aa  45.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3106  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  27.27 
 
 		 606 aa  45.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  33.64 
 
 		 469 aa  45.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2985  PQQ-dependent enzyme-like protein  22.76 
 
 		 618 aa  45.1  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.926915  normal  0.513639 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  20.9 
 
 		 363 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  21.2 
 
 		 402 aa  45.1  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  26.36 
 
 		 820 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3040  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  27.27 
 
 		 608 aa  44.3  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.520136  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  23.14 
 
 		 386 aa  44.3  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2255  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  26.47 
 
 		 588 aa  44.3  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  20.62 
 
 		 363 aa  43.9  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3592  Pyrrolo-quinoline quinone  20.19 
 
 		 442 aa  43.9  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2451  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  23.86 
 
 		 576 aa  44.3  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  28.43 
 
 		 384 aa  43.9  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  21.71 
 
 		 458 aa  43.9  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>