158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1817 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1817  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
400 aa  814    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.216395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  24.03 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  21.37 
 
 
795 aa  72.8  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  24.42 
 
 
431 aa  72.8  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  23.24 
 
 
687 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0865  Pyrrolo-quinoline quinone  25.45 
 
 
611 aa  70.5  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  23.85 
 
 
445 aa  70.5  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  22.27 
 
 
457 aa  68.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  22.49 
 
 
963 aa  64.3  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  20.32 
 
 
445 aa  63.9  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0821  Pyrrolo-quinoline quinone  22.3 
 
 
372 aa  63.5  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.403647  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  22.94 
 
 
450 aa  63.2  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  21.48 
 
 
396 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  20.33 
 
 
653 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  18.86 
 
 
439 aa  62  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  22.06 
 
 
423 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  24.31 
 
 
1454 aa  61.2  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  21.54 
 
 
469 aa  60.1  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  19.51 
 
 
652 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  23.79 
 
 
463 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  23 
 
 
1009 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  23.3 
 
 
432 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  20.98 
 
 
412 aa  57.4  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  22.5 
 
 
387 aa  57  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  20.8 
 
 
705 aa  57  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  22.78 
 
 
556 aa  57  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  28.28 
 
 
611 aa  56.6  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  19.64 
 
 
381 aa  56.2  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  22.3 
 
 
383 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2698  putative quinoprotein  20 
 
 
448 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.578773  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0624  Pyrrolo-quinoline quinone  29.27 
 
 
417 aa  54.7  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  23.11 
 
 
390 aa  54.7  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0990  Pyrrolo-quinoline quinone  25.26 
 
 
441 aa  54.7  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3588  Pyrrolo-quinoline quinone  21.61 
 
 
389 aa  54.3  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.909345  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  21.83 
 
 
395 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40260  YfgL-like phosphoquinolipoprotein kinase  22.39 
 
 
384 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0902958  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  21.83 
 
 
395 aa  54.7  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0208  Pyrrolo-quinoline quinone  20.85 
 
 
1037 aa  53.9  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.731734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  20.07 
 
 
774 aa  53.9  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3214  Pyrrolo-quinoline quinone  21.78 
 
 
349 aa  53.9  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000613548  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004346  YfgL protein  19.92 
 
 
386 aa  53.9  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  21.68 
 
 
1241 aa  53.9  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1359  Pyrrolo-quinoline quinone  22.87 
 
 
377 aa  53.5  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000339921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  21.12 
 
 
475 aa  53.5  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1437  PQQ repeat-containing protein  24.88 
 
 
384 aa  53.1  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.234341  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2426  Pyrrolo-quinoline quinone  18.46 
 
 
440 aa  53.1  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1355  Pyrrolo-quinoline quinone  20 
 
 
454 aa  53.1  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.464809  normal  0.026391 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  20.69 
 
 
386 aa  53.1  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  23.42 
 
 
371 aa  52.8  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0750  PQQ repeat-containing protein  21.59 
 
 
353 aa  52.4  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.137969  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  22.75 
 
 
1328 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  22.76 
 
 
450 aa  52.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  22.07 
 
 
440 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  19.16 
 
 
386 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  21.12 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  23.73 
 
 
371 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  20.87 
 
 
393 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1397  serine/threonine protein kinase  23.3 
 
 
643 aa  51.2  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323701  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2161  Pyrrolo-quinoline quinone  19.49 
 
 
454 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.905715  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3125  Pyrrolo-quinoline quinone  22.33 
 
 
444 aa  51.6  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3315  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  28.66 
 
 
557 aa  50.8  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  23.08 
 
 
475 aa  50.4  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1692  Pyrrolo-quinoline quinone  20.31 
 
 
534 aa  50.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.799639 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0737  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  21.31 
 
 
396 aa  50.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.918396  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0732  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.79 
 
 
385 aa  50.1  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  25 
 
 
616 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  19.67 
 
 
395 aa  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  19.67 
 
 
395 aa  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  21.33 
 
 
461 aa  50.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  24.88 
 
 
611 aa  49.7  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2870  Pyrrolo-quinoline quinone  21.05 
 
 
705 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489222  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  22.88 
 
 
809 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  22.76 
 
 
797 aa  48.9  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1729  Pyrrolo-quinoline quinone  19.81 
 
 
372 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  18.81 
 
 
901 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0619  Pyrrolo-quinoline quinone  21.52 
 
 
373 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.051105  hitchhiker  0.000000261187 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  22.59 
 
 
1311 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  20 
 
 
393 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  22.13 
 
 
415 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  22.16 
 
 
426 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  21.37 
 
 
352 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  21.32 
 
 
1300 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2199  Pyrrolo-quinoline quinone  19.7 
 
 
447 aa  48.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.839815  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3619  Pyrrolo-quinoline quinone  26.67 
 
 
581 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.61 
 
 
393 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0099  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  25.52 
 
 
605 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.850532  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.61 
 
 
393 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  21.69 
 
 
820 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.61 
 
 
393 aa  47.4  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  19.42 
 
 
455 aa  47.4  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0030  Pyrrolo-quinoline quinone  25.69 
 
 
499 aa  47.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.951716  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0029  tetrathionate hydrolase  25.69 
 
 
499 aa  47.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1437  PQQ enzyme repeat domain protein  27.34 
 
 
384 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  27.27 
 
 
399 aa  47  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  22.89 
 
 
484 aa  46.6  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  22.27 
 
 
619 aa  46.6  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  25.14 
 
 
455 aa  46.2  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5502  putative alcohol dehydrogenase  28.85 
 
 
712 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210225  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1323  Pyrrolo-quinoline quinone  21.97 
 
 
639 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1441  Pyrrolo-quinoline quinone  23.27 
 
 
708 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0121309 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>