22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1799 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1799  hypothetical protein  100 
 
 
635 aa  1280    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1801  hypothetical protein  62.98 
 
 
626 aa  697    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204722  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1992  hypothetical protein  62 
 
 
612 aa  664    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  40.76 
 
 
1241 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  39.67 
 
 
2036 aa  251  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  40.55 
 
 
1328 aa  250  6e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  38.24 
 
 
656 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  37.84 
 
 
1842 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  33.33 
 
 
2272 aa  182  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  33.26 
 
 
1969 aa  179  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  34.09 
 
 
1311 aa  167  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  30.23 
 
 
1009 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  29.73 
 
 
834 aa  157  7e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  33.33 
 
 
1067 aa  153  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  31.89 
 
 
809 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  30.7 
 
 
797 aa  144  5e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1960  Pyrrolo-quinoline quinone  30.96 
 
 
484 aa  134  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000174419  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3735  cell surface protein  29.94 
 
 
430 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271044  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04620  FOG: WD40-like repeat protein  26.6 
 
 
1533 aa  59.3  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0893  Pyrrolo-quinoline quinone  29.59 
 
 
645 aa  50.4  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  32.24 
 
 
1812 aa  49.7  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2797  Pyrrolo-quinoline quinone  27.85 
 
 
557 aa  44.7  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>