21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0991 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0991  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 1261 aa  2570    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.620303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04620  FOG: WD40-like repeat protein  38.88 
 
 		 1533 aa  385  1e-105  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1549  Pyrrolo-quinoline quinone  25.65 
 
 		 656 aa  70.5  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.259742  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  27.38 
 
 		 2036 aa  69.7  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  23.91 
 
 		 1009 aa  66.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  24.48 
 
 		 809 aa  65.1  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  21.51 
 
 		 834 aa  63.2  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  23.28 
 
 		 1969 aa  60.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  23.26 
 
 		 1842 aa  56.2  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3735  cell surface protein  24.59 
 
 		 430 aa  56.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  24.21 
 
 		 1311 aa  55.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  25.65 
 
 		 1328 aa  55.5  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  25.26 
 
 		 1241 aa  54.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1067 aa  50.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  21.61 
 
 		 2272 aa  49.3  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0262  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  29.87 
 
 		 737 aa  47.8  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0206165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0905  alcohol dehydrogenase  29.87 
 
 		 711 aa  47.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.879569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2797  Pyrrolo-quinoline quinone  30.43 
 
 		 557 aa  47.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0363  putative alcohol dehydrogenase precursor  30.53 
 
 		 572 aa  46.2  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  26.76 
 
 		 820 aa  46.2  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2878  Pyrrolo-quinoline quinone  27.88 
 
 		 727 aa  45.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>