15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0591 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0591  hypothetical protein  100 
 
 
613 aa  1233    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1890  Pyrrolo-quinoline quinone  30.08 
 
 
552 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  36.09 
 
 
603 aa  82.8  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.140505  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1219  Pyrrolo-quinoline quinone  36.09 
 
 
603 aa  81.3  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391806  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  32.79 
 
 
1682 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  33.93 
 
 
546 aa  55.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  33.33 
 
 
2122 aa  53.9  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  35 
 
 
486 aa  52.4  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  29.13 
 
 
687 aa  53.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  24.64 
 
 
619 aa  48.5  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  22.56 
 
 
611 aa  48.1  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  26.13 
 
 
457 aa  46.6  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  26.85 
 
 
396 aa  45.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  28.21 
 
 
440 aa  44.3  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  20.98 
 
 
963 aa  43.9  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>