30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2345 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2345  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 390 aa  800    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0619  Pyrrolo-quinoline quinone  43.41 
 
 		 373 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.051105  hitchhiker  0.000000261187 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1743  hypothetical protein  29.33 
 
 		 407 aa  179  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  24.85 
 
 		 2122 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  23.53 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  25.56 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  23.03 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  23.2 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1682 aa  62.8  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  21.99 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  22.55 
 
 		 611 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  21.58 
 
 		 463 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  23.3 
 
 		 809 aa  54.7  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  20.43 
 
 		 352 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2698  hypothetical protein  23.33 
 
 		 547 aa  51.2  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.744125  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  24.55 
 
 		 450 aa  50.8  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.08 
 
 		 392 aa  50.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  23.08 
 
 		 392 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  23.94 
 
 		 440 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  22.05 
 
 		 546 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  21.57 
 
 		 687 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  22.31 
 
 		 407 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3390  hypothetical protein  20.51 
 
 		 487 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000496951  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  20.79 
 
 		 774 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  26.73 
 
 		 390 aa  46.6  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.49 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2204  Pyrrolo-quinoline quinone  22.67 
 
 		 444 aa  44.3  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  22.44 
 
 		 705 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  21.56 
 
 		 475 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  23.82 
 
 		 652 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>