135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0794 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0794  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 408 aa  820    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3390  hypothetical protein  31.29 
 
 		 487 aa  142  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000496951  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  28 
 
 		 1656 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0476  WD-40 repeat-containing protein  29.79 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  26.96 
 
 		 1552 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  29.3 
 
 		 1714 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0342  Pyrrolo-quinoline quinone  28.03 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.333089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  26.56 
 
 		 1454 aa  73.2  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.07 
 
 		 1557 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2118  WD-40 repeat protein  32 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.8 
 
 		 1481 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  23.25 
 
 		 1789 aa  67  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.83 
 
 		 1363 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.76 
 
 		 1240 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  27.23 
 
 		 546 aa  65.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  27.54 
 
 		 1553 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  26.19 
 
 		 1523 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.23 
 
 		 1711 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  29.44 
 
 		 564 aa  63.5  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  26.37 
 
 		 1510 aa  63.5  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  23.47 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  24.36 
 
 		 1858 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  26.78 
 
 		 1211 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1682 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  26.39 
 
 		 1364 aa  60.5  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1854  WD-40 repeat-containing protein  24.04 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.417147  normal  0.513594 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.68 
 
 		 677 aa  59.7  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  24.4 
 
 		 778 aa  59.7  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  25.62 
 
 		 1599 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  23.36 
 
 		 1161 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.68 
 
 		 1652 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.92 
 
 		 692 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  23.93 
 
 		 1161 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  26.19 
 
 		 774 aa  58.5  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.29 
 
 		 1072 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  27.34 
 
 		 1807 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0378  hypothetical protein  23.34 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0579188  normal  0.656469 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  27.78 
 
 		 574 aa  57  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.65 
 
 		 1267 aa  57  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  25.51 
 
 		 2122 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25 
 
 		 1868 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.49 
 
 		 1072 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  21.94 
 
 		 1348 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  26.39 
 
 		 1766 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  25.36 
 
 		 1367 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  24.78 
 
 		 322 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25 
 
 		 930 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  28.21 
 
 		 947 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  25.1 
 
 		 352 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  25.68 
 
 		 464 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  26.15 
 
 		 1373 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  23.84 
 
 		 1190 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  25 
 
 		 1221 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  27.65 
 
 		 1247 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  26.05 
 
 		 954 aa  53.1  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  24.18 
 
 		 696 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  24.6 
 
 		 1188 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  24.72 
 
 		 1416 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  21.82 
 
 		 322 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0243  hypothetical protein  21.74 
 
 		 782 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.136544  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  23.53 
 
 		 687 aa  52.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  25.45 
 
 		 335 aa  52.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.7 
 
 		 608 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1219  Pyrrolo-quinoline quinone  24.64 
 
 		 603 aa  50.8  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391806  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  22.11 
 
 		 1229 aa  50.4  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  25.74 
 
 		 1217 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4520  methyltransferase domain protein  24.24 
 
 		 783 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  23.6 
 
 		 1100 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  23.23 
 
 		 578 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  23.45 
 
 		 322 aa  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  25.38 
 
 		 443 aa  49.7  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  21.75 
 
 		 505 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.33 
 
 		 919 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  23.97 
 
 		 1311 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  24.38 
 
 		 1901 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.14 
 
 		 1760 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  24.66 
 
 		 1491 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.16 
 
 		 1623 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  22.53 
 
 		 1164 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.4 
 
 		 622 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 1878 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.14 
 
 		 642 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0763  WD-40 repeat-containing protein  28.12 
 
 		 327 aa  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  24.26 
 
 		 603 aa  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.140505  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  26.15 
 
 		 1236 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  25.71 
 
 		 1411 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.27 
 
 		 312 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  29.41 
 
 		 742 aa  47.4  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.32 
 
 		 740 aa  47.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.5 
 
 		 676 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  28.74 
 
 		 1454 aa  47  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.7 
 
 		 1076 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  25.71 
 
 		 1242 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  24.68 
 
 		 484 aa  46.6  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.32 
 
 		 698 aa  46.6  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.3 
 
 		 842 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  25.18 
 
 		 752 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  26.07 
 
 		 565 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_63551  predicted protein  24.19 
 
 		 522 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  23.99 
 
 		 1213 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>