20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0378 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0378  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  895    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0579188  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3390  hypothetical protein  25.17 
 
 		 487 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000496951  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1854  WD-40 repeat-containing protein  24.01 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.417147  normal  0.513594 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0794  WD-40 repeat-containing protein  23.34 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0476  WD-40 repeat-containing protein  21.84 
 
 		 390 aa  53.5  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204681  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  23.26 
 
 		 324 aa  51.6  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  24.44 
 
 		 322 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  23.53 
 
 		 322 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0640  hypothetical protein  25.19 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  21.95 
 
 		 546 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  21.7 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  22.44 
 
 		 705 aa  47.8  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  26.88 
 
 		 788 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  22.81 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  22.58 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  25.51 
 
 		 687 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  26.51 
 
 		 963 aa  43.5  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1259  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.74 
 
 		 395 aa  43.5  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0514835  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  22.69 
 
 		 457 aa  43.1  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  30 
 
 		 387 aa  43.1  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>