72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1854 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1854  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 419 aa  829    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.417147  normal  0.513594 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0342  Pyrrolo-quinoline quinone  27.16 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.333089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  30.16 
 
 		 1789 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  28.99 
 
 		 1656 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3390  hypothetical protein  25.49 
 
 		 487 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000496951  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  30.22 
 
 		 1523 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  28.62 
 
 		 1599 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2118  WD-40 repeat protein  23.55 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0476  WD-40 repeat-containing protein  36.6 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.2 
 
 		 1557 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.99 
 
 		 1481 aa  67  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.3 
 
 		 1240 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.38 
 
 		 1652 aa  60.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  24.92 
 
 		 1454 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  26.98 
 
 		 1510 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.75 
 
 		 692 aa  57  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0378  hypothetical protein  24.01 
 
 		 440 aa  56.2  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0579188  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0794  WD-40 repeat-containing protein  24.06 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  30 
 
 		 1211 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  29.37 
 
 		 1858 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.6 
 
 		 1262 aa  54.3  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  26.9 
 
 		 1552 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.91 
 
 		 1711 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  23.33 
 
 		 1363 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  26.45 
 
 		 1714 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.8 
 
 		 675 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.38 
 
 		 740 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3363  WD-40 repeat protein  26.56 
 
 		 826 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.85 
 
 		 919 aa  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.86 
 
 		 698 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  27.14 
 
 		 742 aa  50.1  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.66 
 
 		 642 aa  49.7  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0547  WD-40 repeat protein  27.37 
 
 		 477 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  27.98 
 
 		 696 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  26.46 
 
 		 1553 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  28.33 
 
 		 778 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.24 
 
 		 1686 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  24.36 
 
 		 1357 aa  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  23 
 
 		 687 aa  47.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  25.57 
 
 		 1311 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.24 
 
 		 677 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.92 
 
 		 1583 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.63 
 
 		 737 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  24.44 
 
 		 1213 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  30.61 
 
 		 1100 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  26.1 
 
 		 1348 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1682 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  22.61 
 
 		 589 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1477 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  33.66 
 
 		 1484 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0112  hypothetical protein  27.3 
 
 		 846 aa  45.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0116921 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.53 
 
 		 1684 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.96 
 
 		 1076 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 		 1334 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0674  WD-40 repeat protein  22.88 
 
 		 363 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0693  WD-40 repeat protein  22.88 
 
 		 363 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00188435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  28.4 
 
 		 344 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  22.58 
 
 		 1364 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.18 
 
 		 1163 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  25.64 
 
 		 1443 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.04 
 
 		 608 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  29.52 
 
 		 1373 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.02 
 
 		 1072 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  31.07 
 
 		 608 aa  43.9  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  29.33 
 
 		 1177 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.02 
 
 		 1072 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  25.93 
 
 		 440 aa  43.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.27 
 
 		 1004 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.98 
 
 		 1868 aa  43.5  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.87 
 
 		 1760 aa  43.5  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  24.1 
 
 		 1176 aa  43.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.56 
 
 		 1626 aa  43.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>