12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0112 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1156  hypothetical protein  97.04 
 
 
846 aa  1578    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000505195 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0090  hypothetical protein  57.77 
 
 
860 aa  902    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000863747 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0119  hypothetical protein  47.73 
 
 
901 aa  727    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0112  hypothetical protein  100 
 
 
846 aa  1665    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0116921 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1462  hypothetical protein  28.94 
 
 
689 aa  147  9e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.947543  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1873  hypothetical protein  34.15 
 
 
603 aa  62.4  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.505982  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1212  hypothetical protein  27.78 
 
 
510 aa  48.5  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290605  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1218  peptidase A5, thermopsin  27.18 
 
 
944 aa  46.2  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00267921  normal  0.64223 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1854  WD-40 repeat-containing protein  27.3 
 
 
419 aa  46.2  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.417147  normal  0.513594 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0003  hypothetical protein  22.58 
 
 
1149 aa  45.8  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2118  WD-40 repeat protein  25.55 
 
 
400 aa  44.3  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  23.94 
 
 
1656 aa  44.3  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>