35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2118 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2118  WD-40 repeat protein  100 
 
 		 400 aa  801    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0342  Pyrrolo-quinoline quinone  30.15 
 
 		 441 aa  147  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.333089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3390  hypothetical protein  27.3 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000496951  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1854  WD-40 repeat-containing protein  23.87 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.417147  normal  0.513594 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0794  WD-40 repeat-containing protein  31.4 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0476  WD-40 repeat-containing protein  26.47 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.92 
 
 		 1557 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  24.46 
 
 		 1656 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  23.36 
 
 		 1161 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  23.62 
 
 		 1161 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  21.98 
 
 		 1789 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42874  predicted protein  30.1 
 
 		 572 aa  54.7  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0187431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  28.86 
 
 		 1242 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  25.88 
 
 		 1190 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  31.4 
 
 		 565 aa  47  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.01 
 
 		 1240 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.28 
 
 		 1609 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  22.98 
 
 		 1247 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5675  Pyrrolo-quinoline quinone  28.05 
 
 		 994 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3070  WD-40 repeat protein  28.5 
 
 		 438 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4520  methyltransferase domain protein  26.55 
 
 		 783 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  24.48 
 
 		 1100 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  23.12 
 
 		 1714 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  23.84 
 
 		 657 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.34 
 
 		 675 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2844  WD-40 repeat-containing protein  28.5 
 
 		 440 aa  45.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0304  putative lipoprotein  25.23 
 
 		 338 aa  44.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.404222  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0090  hypothetical protein  37.36 
 
 		 860 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000863747 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  26.5 
 
 		 505 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  21.78 
 
 		 1348 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0112  hypothetical protein  25.55 
 
 		 846 aa  44.3  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0116921 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.13 
 
 		 1262 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  23.2 
 
 		 546 aa  43.9  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  22.34 
 
 		 742 aa  43.5  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  21.6 
 
 		 322 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>