More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0304 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0304  putative lipoprotein  100 
 
 		 338 aa  695    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.404222  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00063  hypothetical protein  61.13 
 
 		 328 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002291  hypothetical protein  61.72 
 
 		 328 aa  438  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000281233  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2764  putative lipoprotein  55.79 
 
 		 327 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0436  hypothetical protein  40 
 
 		 327 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0109  WD-40 repeat-containing protein  39.25 
 
 		 324 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000219456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03985  WD-40 repeat protein  37.27 
 
 		 320 aa  252  6e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00637203  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1064  hypothetical protein  31.63 
 
 		 316 aa  179  8e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0917  WD-40 repeat-containing protein  36.67 
 
 		 319 aa  175  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000268959  normal  0.0477605 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0902  WD-40 repeat-containing protein  32.53 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0939  WD-40 repeat-containing protein  31.63 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000121304  normal  0.0978141 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3399  WD-40 repeat protein  31.93 
 
 		 316 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0888  WD-40 repeat-containing protein  31.93 
 
 		 316 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000055651  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3474  WD-40 repeat-containing protein  31.93 
 
 		 316 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000147643  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3597  WD-40 repeat-containing protein  31.63 
 
 		 316 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000016405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3035  WD-40 repeat-containing protein  31.33 
 
 		 316 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000963401  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3011  WD-40 repeat-containing protein  31.33 
 
 		 316 aa  169  9e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000211849  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0839  WD-40 repeat-containing protein  30.91 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000151592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0967  WD-40 repeat-containing protein  32.63 
 
 		 319 aa  165  8e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000101779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3239  WD-40 repeat-containing protein  31.38 
 
 		 322 aa  159  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000819869  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2910  WD-40 repeat-containing protein  32.13 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000305782  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4706  putative lipoprotein  34.03 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0641  hypothetical protein  32.52 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000056191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3587  hypothetical protein  28.43 
 
 		 328 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000116276  normal  0.305585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3925  WD-40 repeat-containing protein  25.22 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  28.74 
 
 		 947 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  30 
 
 		 1229 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  31.76 
 
 		 696 aa  92.8  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  30.8 
 
 		 1163 aa  91.3  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  29.28 
 
 		 1553 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1510 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.96 
 
 		 1481 aa  87.8  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  36.59 
 
 		 1364 aa  87.4  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  29.52 
 
 		 1363 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0763  WD-40 repeat-containing protein  23.78 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  30.64 
 
 		 1280 aa  85.9  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  32.91 
 
 		 1652 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  26.7 
 
 		 1330 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0588  WD-40 repeat-containing protein  21.88 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  28.08 
 
 		 1454 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.75 
 
 		 792 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  28.88 
 
 		 1236 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  31.13 
 
 		 1211 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  30 
 
 		 778 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  25 
 
 		 1411 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  26.61 
 
 		 564 aa  80.5  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3363  WD-40 repeat protein  29.67 
 
 		 826 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.12 
 
 		 1868 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  28.44 
 
 		 1367 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  36.02 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  28.8 
 
 		 1484 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.84 
 
 		 676 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  28.43 
 
 		 1831 aa  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  28.32 
 
 		 1242 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  25.71 
 
 		 505 aa  77  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.67 
 
 		 930 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  27.53 
 
 		 1247 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  25.95 
 
 		 1214 aa  76.6  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.25 
 
 		 1262 aa  76.6  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.62 
 
 		 677 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  28.16 
 
 		 687 aa  76.3  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  25.91 
 
 		 657 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2183  WD-40 repeat protein  28.8 
 
 		 772 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2135  WD-40 repeat protein  28.8 
 
 		 772 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.53 
 
 		 1856 aa  75.1  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  27.47 
 
 		 1188 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  30.85 
 
 		 774 aa  75.1  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  25.11 
 
 		 1213 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  27.9 
 
 		 1357 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  29.55 
 
 		 1416 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3483  WD-40 repeat-containing protein  21.2 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  22.87 
 
 		 1188 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 1221 aa  72.8  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  32.3 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  26.96 
 
 		 1878 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.41 
 
 		 1823 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.72 
 
 		 1686 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  31.9 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.98 
 
 		 608 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3169  WD-40 repeat-containing protein  22.55 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.19 
 
 		 630 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  28.93 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0674  WD-40 repeat protein  25.97 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.65 
 
 		 1205 aa  70.9  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0693  WD-40 repeat protein  25.97 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00188435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  29.67 
 
 		 1656 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  28.85 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  26.24 
 
 		 742 aa  70.1  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  23.4 
 
 		 1196 aa  69.3  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  24.71 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  27.48 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  26.27 
 
 		 589 aa  69.3  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32006  WD domain protein  26.82 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.48 
 
 		 698 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.63 
 
 		 682 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.68 
 
 		 692 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3932  WD-40 repeat-containing protein  28.3 
 
 		 914 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237365  unclonable  0.0000634097 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  27.78 
 
 		 1443 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.74 
 
 		 1557 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  24.36 
 
 		 1807 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>