More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0436 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0436  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  674    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0109  WD-40 repeat-containing protein  47.91 
 
 		 324 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000219456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03985  WD-40 repeat protein  42.99 
 
 		 320 aa  308  8e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00637203  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002291  hypothetical protein  42.41 
 
 		 328 aa  278  8e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000281233  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00063  hypothetical protein  41.14 
 
 		 328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0304  putative lipoprotein  40 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.404222  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2764  putative lipoprotein  37.54 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0917  WD-40 repeat-containing protein  38.12 
 
 		 319 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000268959  normal  0.0477605 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0839  WD-40 repeat-containing protein  37.54 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000151592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3239  WD-40 repeat-containing protein  37.34 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000819869  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1064  hypothetical protein  37.66 
 
 		 316 aa  206  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3011  WD-40 repeat-containing protein  37.3 
 
 		 316 aa  204  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000211849  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0967  WD-40 repeat-containing protein  36.56 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000101779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0902  WD-40 repeat-containing protein  36.08 
 
 		 316 aa  202  7e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0939  WD-40 repeat-containing protein  35.6 
 
 		 316 aa  202  9e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000121304  normal  0.0978141 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3035  WD-40 repeat-containing protein  35.6 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000963401  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3597  WD-40 repeat-containing protein  35.76 
 
 		 316 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000016405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3399  WD-40 repeat protein  35.44 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0888  WD-40 repeat-containing protein  35.44 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000055651  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3474  WD-40 repeat-containing protein  35.44 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000147643  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2910  WD-40 repeat-containing protein  34.06 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000305782  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3587  hypothetical protein  29.85 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000116276  normal  0.305585 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0641  hypothetical protein  33.85 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000056191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0763  WD-40 repeat-containing protein  29.77 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3925  WD-40 repeat-containing protein  27.88 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0588  WD-40 repeat-containing protein  27.65 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4706  putative lipoprotein  30.42 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.76 
 
 		 1481 aa  106  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3483  WD-40 repeat-containing protein  24.84 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  28.09 
 
 		 1510 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  28.57 
 
 		 1163 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3169  WD-40 repeat-containing protein  25.97 
 
 		 332 aa  99.8  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  27.98 
 
 		 1363 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  26.64 
 
 		 1553 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  26.22 
 
 		 947 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  26.76 
 
 		 1229 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  27.24 
 
 		 1188 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  24.18 
 
 		 1188 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  26.76 
 
 		 1280 aa  93.2  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  27.05 
 
 		 1454 aa  93.2  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.02 
 
 		 930 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  25.65 
 
 		 1523 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  31.03 
 
 		 1652 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  25.1 
 
 		 505 aa  89.7  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  26.96 
 
 		 443 aa  86.7  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.89 
 
 		 1205 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  22.92 
 
 		 1213 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  27.05 
 
 		 574 aa  85.1  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  26.67 
 
 		 564 aa  84.7  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.85 
 
 		 677 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  26.97 
 
 		 1367 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  28.14 
 
 		 782 aa  84  0.000000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1474 aa  83.2  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.23 
 
 		 792 aa  83.2  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.04 
 
 		 1236 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  23.42 
 
 		 1193 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.19 
 
 		 1868 aa  82.8  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  27.45 
 
 		 1242 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  27.24 
 
 		 696 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 1221 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  26.78 
 
 		 335 aa  80.5  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.8 
 
 		 698 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  23.4 
 
 		 1330 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2183  WD-40 repeat protein  31.43 
 
 		 772 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2135  WD-40 repeat protein  31.43 
 
 		 772 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3932  WD-40 repeat-containing protein  22.87 
 
 		 914 aa  80.1  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237365  unclonable  0.0000634097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.86 
 
 		 1686 aa  80.1  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  26.64 
 
 		 578 aa  79.7  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  26.72 
 
 		 1807 aa  79.7  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  28.99 
 
 		 778 aa  79.7  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  28.14 
 
 		 742 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  26.34 
 
 		 687 aa  79.7  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.11 
 
 		 676 aa  79.3  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.67 
 
 		 630 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  22.92 
 
 		 464 aa  79  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.43 
 
 		 682 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  26.21 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  26.43 
 
 		 1831 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.67 
 
 		 733 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  25.27 
 
 		 1901 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  23.14 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  23.25 
 
 		 1247 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  25.51 
 
 		 316 aa  76.6  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  28.43 
 
 		 1211 aa  76.6  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  25.11 
 
 		 346 aa  75.9  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  25.19 
 
 		 1484 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  26.79 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.47 
 
 		 1856 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.01 
 
 		 664 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  28.16 
 
 		 1161 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  25.35 
 
 		 1357 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  28.16 
 
 		 1161 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  27.97 
 
 		 1364 aa  73.9  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  22.38 
 
 		 589 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  30.18 
 
 		 1311 aa  72.8  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.92 
 
 		 692 aa  72.8  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  23.91 
 
 		 774 aa  72.8  0.000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  25.88 
 
 		 434 aa  72  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.02 
 
 		 1557 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1097 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>