More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03985 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03985  WD-40 repeat protein  100 
 
 		 320 aa  659    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00637203  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0109  WD-40 repeat-containing protein  63.73 
 
 		 324 aa  423  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000219456  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0436  hypothetical protein  42.99 
 
 		 327 aa  308  8e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00063  hypothetical protein  40.75 
 
 		 328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002291  hypothetical protein  41.07 
 
 		 328 aa  265  7e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000281233  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0304  putative lipoprotein  37.27 
 
 		 338 aa  252  5.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.404222  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2764  putative lipoprotein  37.11 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3011  WD-40 repeat-containing protein  38.05 
 
 		 316 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000211849  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0939  WD-40 repeat-containing protein  38.28 
 
 		 316 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000121304  normal  0.0978141 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1064  hypothetical protein  36.91 
 
 		 316 aa  210  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0839  WD-40 repeat-containing protein  36.3 
 
 		 322 aa  209  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000151592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0902  WD-40 repeat-containing protein  37.59 
 
 		 316 aa  209  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3035  WD-40 repeat-containing protein  37.59 
 
 		 316 aa  206  6e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000963401  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3399  WD-40 repeat protein  37.59 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0888  WD-40 repeat-containing protein  37.59 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000055651  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3239  WD-40 repeat-containing protein  36.39 
 
 		 322 aa  202  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000819869  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3474  WD-40 repeat-containing protein  37.24 
 
 		 316 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000147643  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3597  WD-40 repeat-containing protein  36.9 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000016405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0917  WD-40 repeat-containing protein  35.81 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000268959  normal  0.0477605 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0967  WD-40 repeat-containing protein  37.5 
 
 		 319 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000101779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2910  WD-40 repeat-containing protein  37.72 
 
 		 318 aa  192  7e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000305782  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0641  hypothetical protein  34.72 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000056191  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4706  putative lipoprotein  29.39 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3587  hypothetical protein  28.37 
 
 		 328 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000116276  normal  0.305585 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0588  WD-40 repeat-containing protein  26.11 
 
 		 313 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3925  WD-40 repeat-containing protein  23.69 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0763  WD-40 repeat-containing protein  24.59 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3483  WD-40 repeat-containing protein  25.62 
 
 		 354 aa  106  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  28.03 
 
 		 1510 aa  105  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.24 
 
 		 1481 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  24.83 
 
 		 1213 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  26.43 
 
 		 1229 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3363  WD-40 repeat protein  26.32 
 
 		 826 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  28.19 
 
 		 1553 aa  97.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3169  WD-40 repeat-containing protein  23.49 
 
 		 332 aa  96.3  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  26.22 
 
 		 1188 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  27.17 
 
 		 1454 aa  93.6  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  26.9 
 
 		 1161 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  26.55 
 
 		 1161 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  26.52 
 
 		 1211 aa  89.7  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  25.1 
 
 		 1163 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  25.9 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.07 
 
 		 677 aa  86.7  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  26.04 
 
 		 344 aa  85.9  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  22.14 
 
 		 947 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  26.59 
 
 		 1367 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.86 
 
 		 919 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  28.57 
 
 		 778 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  27.94 
 
 		 1280 aa  84.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  25.2 
 
 		 1523 aa  83.2  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  24.77 
 
 		 1217 aa  83.6  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0693  WD-40 repeat protein  22.52 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00188435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  25.31 
 
 		 1242 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.43 
 
 		 1363 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.35 
 
 		 740 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  27.24 
 
 		 1552 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  23.63 
 
 		 1901 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  25.91 
 
 		 564 aa  81.3  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2798  WD40 domain-containing protein  24.59 
 
 		 597 aa  81.6  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  26.26 
 
 		 1477 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0674  WD-40 repeat protein  22.52 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  25.91 
 
 		 1247 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.48 
 
 		 676 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  27.7 
 
 		 1097 aa  80.1  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  26.44 
 
 		 696 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.32 
 
 		 924 aa  79.3  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  23.44 
 
 		 687 aa  79.3  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  23.23 
 
 		 505 aa  79  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  25.31 
 
 		 578 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  34.19 
 
 		 1205 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 1221 aa  77.4  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  23.51 
 
 		 1188 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.38 
 
 		 930 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  27.27 
 
 		 1330 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.44 
 
 		 1856 aa  76.6  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  25.17 
 
 		 1807 aa  76.6  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  26.29 
 
 		 774 aa  76.3  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  31.34 
 
 		 1236 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  26.85 
 
 		 1484 aa  75.9  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  22.18 
 
 		 1474 aa  75.9  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.47 
 
 		 1557 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  24.33 
 
 		 782 aa  74.3  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.34 
 
 		 1364 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  25.11 
 
 		 657 aa  75.1  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.32 
 
 		 1686 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  24.21 
 
 		 1766 aa  73.9  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  24.59 
 
 		 1348 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  26.22 
 
 		 1357 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  23.86 
 
 		 1416 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.07 
 
 		 608 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  23.89 
 
 		 1831 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  24.32 
 
 		 1164 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  23.89 
 
 		 574 aa  73.2  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1339  WD-40 repeat-containing protein  27.5 
 
 		 504 aa  73.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143259  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.02 
 
 		 1652 aa  73.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.49 
 
 		 792 aa  73.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  23.05 
 
 		 589 aa  72.8  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  26.36 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.52 
 
 		 1684 aa  71.2  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  31.01 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>