234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3474 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3474  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 316 aa  639    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000147643  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3399  WD-40 repeat protein  99.68 
 
 		 316 aa  637    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3597  WD-40 repeat-containing protein  99.37 
 
 		 316 aa  636    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000016405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0888  WD-40 repeat-containing protein  99.37 
 
 		 316 aa  637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000055651  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3011  WD-40 repeat-containing protein  87.03 
 
 		 316 aa  568  1e-161  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000211849  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0902  WD-40 repeat-containing protein  84.81 
 
 		 316 aa  560  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0939  WD-40 repeat-containing protein  84.49 
 
 		 316 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000121304  normal  0.0978141 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1064  hypothetical protein  83.86 
 
 		 316 aa  555  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3035  WD-40 repeat-containing protein  84.18 
 
 		 316 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000963401  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0917  WD-40 repeat-containing protein  63.06 
 
 		 319 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000268959  normal  0.0477605 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0967  WD-40 repeat-containing protein  58.6 
 
 		 319 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000101779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3239  WD-40 repeat-containing protein  55.81 
 
 		 322 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000819869  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0839  WD-40 repeat-containing protein  55.48 
 
 		 322 aa  347  2e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000151592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2910  WD-40 repeat-containing protein  50.96 
 
 		 318 aa  319  5e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000305782  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0641  hypothetical protein  51.91 
 
 		 325 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000056191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0109  WD-40 repeat-containing protein  38.68 
 
 		 324 aa  210  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000219456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03985  WD-40 repeat protein  37.24 
 
 		 320 aa  202  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00637203  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0436  hypothetical protein  35.44 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002291  hypothetical protein  34.07 
 
 		 328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000281233  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0304  putative lipoprotein  31.93 
 
 		 338 aa  172  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.404222  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00063  hypothetical protein  32.39 
 
 		 328 aa  169  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2764  putative lipoprotein  32.28 
 
 		 327 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0763  WD-40 repeat-containing protein  29.39 
 
 		 327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4706  putative lipoprotein  27.69 
 
 		 326 aa  123  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3925  WD-40 repeat-containing protein  25.86 
 
 		 332 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3587  hypothetical protein  24.84 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000116276  normal  0.305585 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0588  WD-40 repeat-containing protein  25.58 
 
 		 313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  28.24 
 
 		 1454 aa  90.1  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  27.05 
 
 		 1229 aa  86.7  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.28 
 
 		 1481 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  27.62 
 
 		 1510 aa  80.5  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  27.15 
 
 		 1217 aa  80.1  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  27.14 
 
 		 1553 aa  79.3  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3483  WD-40 repeat-containing protein  21.16 
 
 		 354 aa  79  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  32.55 
 
 		 696 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  27.05 
 
 		 1523 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  29.81 
 
 		 1211 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3169  WD-40 repeat-containing protein  23.16 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.33 
 
 		 1364 aa  70.9  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  27.16 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  28.81 
 
 		 1214 aa  70.5  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  24.91 
 
 		 947 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  27.73 
 
 		 1807 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  26.62 
 
 		 774 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  30.52 
 
 		 1652 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  30.99 
 
 		 1474 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  25.78 
 
 		 1280 aa  66.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  31.84 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.99 
 
 		 1557 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  29.25 
 
 		 1656 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  26.98 
 
 		 1357 aa  64.7  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  25.19 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  24.79 
 
 		 578 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  26.51 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  30.04 
 
 		 790 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.4 
 
 		 1163 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  29.07 
 
 		 1766 aa  64.3  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.72 
 
 		 675 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  29.67 
 
 		 574 aa  63.2  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  29.32 
 
 		 742 aa  63.2  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 1221 aa  62.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.81 
 
 		 630 aa  62.8  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.09 
 
 		 1868 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  25.19 
 
 		 657 aa  62  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.19 
 
 		 1856 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  26.47 
 
 		 778 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  27.5 
 
 		 1242 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  29.56 
 
 		 1367 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.1 
 
 		 1363 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  33.81 
 
 		 342 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  29.55 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  25.71 
 
 		 1484 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2135  WD-40 repeat protein  33.99 
 
 		 772 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2183  WD-40 repeat protein  33.99 
 
 		 772 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.42 
 
 		 930 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.55 
 
 		 792 aa  59.7  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0977  WD-40 repeat-containing protein  26.56 
 
 		 580 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.121052  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  28.34 
 
 		 564 aa  58.9  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.91 
 
 		 682 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.94 
 
 		 1686 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  25.48 
 
 		 589 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  25.1 
 
 		 1552 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  28.05 
 
 		 1831 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  36.36 
 
 		 954 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  26.85 
 
 		 1188 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.1 
 
 		 677 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  26.96 
 
 		 1193 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  28.46 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  29.59 
 
 		 1348 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  28.51 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  34.38 
 
 		 1097 aa  57  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  23.97 
 
 		 1152 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0958  WD-40 repeat-containing protein  22.36 
 
 		 580 aa  57  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  26.64 
 
 		 1190 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  27.78 
 
 		 1188 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3932  WD-40 repeat-containing protein  25.71 
 
 		 914 aa  56.6  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237365  unclonable  0.0000634097 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  27.84 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.9 
 
 		 1205 aa  55.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.77 
 
 		 676 aa  55.8  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3437  WD-40 repeat protein  24.69 
 
 		 1160 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.67443  normal  0.247289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>