136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2910 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2910  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 318 aa  642    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000305782  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3239  WD-40 repeat-containing protein  61.06 
 
 		 322 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000819869  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0902  WD-40 repeat-containing protein  55.1 
 
 		 316 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0939  WD-40 repeat-containing protein  54.46 
 
 		 316 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000121304  normal  0.0978141 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3035  WD-40 repeat-containing protein  54.46 
 
 		 316 aa  350  1e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000963401  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1064  hypothetical protein  52.87 
 
 		 316 aa  343  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3011  WD-40 repeat-containing protein  52.23 
 
 		 316 aa  343  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000211849  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3399  WD-40 repeat protein  50.96 
 
 		 316 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0888  WD-40 repeat-containing protein  50.96 
 
 		 316 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000055651  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3474  WD-40 repeat-containing protein  50.96 
 
 		 316 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000147643  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3597  WD-40 repeat-containing protein  50.96 
 
 		 316 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000016405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0967  WD-40 repeat-containing protein  50.63 
 
 		 319 aa  325  7e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000101779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0917  WD-40 repeat-containing protein  50.63 
 
 		 319 aa  322  6e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000268959  normal  0.0477605 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0839  WD-40 repeat-containing protein  50.32 
 
 		 322 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000151592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0641  hypothetical protein  48.89 
 
 		 325 aa  272  6e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000056191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0109  WD-40 repeat-containing protein  38.31 
 
 		 324 aa  202  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000219456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03985  WD-40 repeat protein  37.72 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00637203  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0436  hypothetical protein  34.06 
 
 		 327 aa  189  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002291  hypothetical protein  33.23 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000281233  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00063  hypothetical protein  32.31 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2764  putative lipoprotein  32.49 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0304  putative lipoprotein  32.13 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.404222  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0763  WD-40 repeat-containing protein  27.71 
 
 		 327 aa  122  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4706  putative lipoprotein  29.48 
 
 		 326 aa  119  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0588  WD-40 repeat-containing protein  26.6 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3925  WD-40 repeat-containing protein  26.85 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3587  hypothetical protein  25.65 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000116276  normal  0.305585 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3483  WD-40 repeat-containing protein  25.31 
 
 		 354 aa  104  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3169  WD-40 repeat-containing protein  25.64 
 
 		 332 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  24.79 
 
 		 578 aa  63.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25 
 
 		 1868 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  27.34 
 
 		 1211 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  29.13 
 
 		 947 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  26.89 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  25.41 
 
 		 1416 aa  60.1  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.54 
 
 		 733 aa  59.3  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  21.51 
 
 		 774 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  25.62 
 
 		 1229 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.45 
 
 		 1205 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  28.1 
 
 		 1188 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  23.61 
 
 		 1454 aa  57  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  27.65 
 
 		 1242 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  29.56 
 
 		 1214 aa  56.2  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  24.31 
 
 		 589 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  22.85 
 
 		 1367 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  25.86 
 
 		 1163 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.27 
 
 		 1481 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  25.9 
 
 		 1552 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  24.05 
 
 		 1474 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0384  WD-40 repeat-containing protein  27.54 
 
 		 423 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32128  predicted protein  21.35 
 
 		 319 aa  53.9  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599879 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  22.99 
 
 		 1213 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.77 
 
 		 636 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  23.28 
 
 		 1510 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  26.09 
 
 		 1280 aa  52.8  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.62 
 
 		 930 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24.1 
 
 		 1363 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  25.98 
 
 		 1901 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  26.32 
 
 		 574 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.09 
 
 		 1686 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  25.31 
 
 		 1484 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  24.87 
 
 		 1188 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32777  predicted protein  23.12 
 
 		 461 aa  49.7  0.00007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.535104  normal  0.359872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  25.48 
 
 		 1477 aa  49.3  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  23.2 
 
 		 1161 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  21.97 
 
 		 1553 aa  49.3  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.48 
 
 		 792 aa  49.3  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65683  U3 snoRNP protein  24.23 
 
 		 951 aa  49.3  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  22.04 
 
 		 1041 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  25.33 
 
 		 505 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.54 
 
 		 1609 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  20.81 
 
 		 728 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.84 
 
 		 698 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2183  WD-40 repeat protein  31.43 
 
 		 772 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  26.92 
 
 		 1193 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25.85 
 
 		 696 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  25.85 
 
 		 1209 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2135  WD-40 repeat protein  31.43 
 
 		 772 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.29 
 
 		 682 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  22 
 
 		 1330 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  22.88 
 
 		 1523 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  23.35 
 
 		 1807 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.18 
 
 		 919 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  28.8 
 
 		 589 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 1221 aa  47  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0958  WD-40 repeat-containing protein  22.88 
 
 		 580 aa  47  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0977  WD-40 repeat-containing protein  22.88 
 
 		 580 aa  47  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.121052  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.7 
 
 		 576 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  24.29 
 
 		 1858 aa  46.2  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  26.76 
 
 		 1411 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.27 
 
 		 1236 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  25.32 
 
 		 778 aa  46.2  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3932  WD-40 repeat-containing protein  26.74 
 
 		 914 aa  46.2  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237365  unclonable  0.0000634097 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00940  transcription initiation factor tfiid 90 kda subunit (tafii-90), putative  30.77 
 
 		 813 aa  45.8  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.152566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7310  WD-40 repeat-containing protein  29.63 
 
 		 473 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  25 
 
 		 564 aa  45.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.54 
 
 		 1398 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.33 
 
 		 1557 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  25.45 
 
 		 1357 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26 
 
 		 608 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>