251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7310 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7310  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 473 aa  902    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.88 
 
 		 833 aa  129  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.25 
 
 		 865 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.78 
 
 		 828 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  33.23 
 
 		 1491 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  33.55 
 
 		 1280 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.33 
 
 		 737 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 		 1334 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  33.85 
 
 		 1484 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  30.9 
 
 		 405 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  26.21 
 
 		 1657 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.91 
 
 		 919 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  32.91 
 
 		 1344 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0523  WD-40 repeat-containing protein  29.84 
 
 		 461 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  28.52 
 
 		 1477 aa  90.5  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.77 
 
 		 806 aa  90.1  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  25.24 
 
 		 505 aa  87  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  27.37 
 
 		 1265 aa  86.7  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  32.56 
 
 		 1152 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  25.22 
 
 		 687 aa  81.6  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  33.62 
 
 		 1401 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3395  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.76 
 
 		 729 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0235207  normal  0.820289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.06 
 
 		 716 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  26.5 
 
 		 1230 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.57 
 
 		 898 aa  80.1  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  22.9 
 
 		 1652 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  25.81 
 
 		 1161 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  25.45 
 
 		 1161 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  32.13 
 
 		 675 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3798  WD40 repeat, subgroup  27.86 
 
 		 1301 aa  77.8  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1125  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.26 
 
 		 682 aa  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.217708 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  31.51 
 
 		 1454 aa  77  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  28.1 
 
 		 1367 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.32 
 
 		 924 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3002  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.9 
 
 		 835 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.774494  normal  0.214944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4047  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.44 
 
 		 916 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  24.92 
 
 		 947 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  24.84 
 
 		 1196 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.5 
 
 		 630 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  28.09 
 
 		 1242 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24.78 
 
 		 1363 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.51 
 
 		 943 aa  73.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  31.62 
 
 		 1523 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  28 
 
 		 1355 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.08 
 
 		 677 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  23.57 
 
 		 1789 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.76 
 
 		 1623 aa  71.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  27.73 
 
 		 1190 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.34 
 
 		 733 aa  71.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  25.79 
 
 		 1163 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  30 
 
 		 1214 aa  70.5  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 1221 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  28.16 
 
 		 1416 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.01 
 
 		 1205 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0674  WD-40 repeat protein  22.81 
 
 		 363 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.97 
 
 		 676 aa  69.3  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0693  WD-40 repeat protein  23.1 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00188435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002291  hypothetical protein  29.69 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000281233  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  24.92 
 
 		 1348 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.82 
 
 		 1481 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  26.78 
 
 		 1157 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.52 
 
 		 1262 aa  67.8  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.82 
 
 		 698 aa  67.8  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  26.49 
 
 		 540 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2764  putative lipoprotein  31.64 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  29.83 
 
 		 652 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  26.91 
 
 		 346 aa  67  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1793  transcriptional regulator, XRE family  23 
 
 		 901 aa  67  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03808  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.03 
 
 		 1617 aa  67  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  24.81 
 
 		 464 aa  66.6  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  26.69 
 
 		 1553 aa  67  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4380  Serine/threonine protein kinase-like protein  26.6 
 
 		 1153 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594701  normal  0.339679 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.78 
 
 		 608 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.3 
 
 		 1557 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2761  WD-40 repeat-containing protein  26.72 
 
 		 1117 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645221  normal  0.818272 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  25.56 
 
 		 1304 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  23.57 
 
 		 578 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  25.5 
 
 		 1364 aa  64.3  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  27.03 
 
 		 1901 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.31 
 
 		 1868 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  27.99 
 
 		 1217 aa  63.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  23.18 
 
 		 657 aa  62.8  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  26.97 
 
 		 1807 aa  62  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  26.99 
 
 		 742 aa  62.4  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.17 
 
 		 682 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  23.8 
 
 		 1599 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  27.14 
 
 		 1510 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.49 
 
 		 757 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.28 
 
 		 930 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.83 
 
 		 1256 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00063  hypothetical protein  29.3 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  24.6 
 
 		 1236 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  25.73 
 
 		 589 aa  61.2  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.84 
 
 		 1684 aa  60.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  23.68 
 
 		 774 aa  60.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  26.21 
 
 		 1357 aa  60.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  23.51 
 
 		 1164 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  22.83 
 
 		 1552 aa  60.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  23.81 
 
 		 1213 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  27.4 
 
 		 574 aa  60.1  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>