217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3035 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3035  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 316 aa  642    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000963401  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0939  WD-40 repeat-containing protein  98.73 
 
 		 316 aa  633  1e-180  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000121304  normal  0.0978141 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0902  WD-40 repeat-containing protein  95.57 
 
 		 316 aa  618  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1064  hypothetical protein  87.97 
 
 		 316 aa  579  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3474  WD-40 repeat-containing protein  84.18 
 
 		 316 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000147643  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3399  WD-40 repeat protein  83.86 
 
 		 316 aa  554  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0888  WD-40 repeat-containing protein  83.54 
 
 		 316 aa  554  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000055651  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3011  WD-40 repeat-containing protein  85.13 
 
 		 316 aa  556  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000211849  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3597  WD-40 repeat-containing protein  83.54 
 
 		 316 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000016405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0917  WD-40 repeat-containing protein  61.46 
 
 		 319 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000268959  normal  0.0477605 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0967  WD-40 repeat-containing protein  58.28 
 
 		 319 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000101779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3239  WD-40 repeat-containing protein  52.96 
 
 		 322 aa  343  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000819869  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2910  WD-40 repeat-containing protein  54.46 
 
 		 318 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000305782  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0839  WD-40 repeat-containing protein  53.58 
 
 		 322 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000151592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0641  hypothetical protein  52.4 
 
 		 325 aa  312  4.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000056191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0109  WD-40 repeat-containing protein  38.14 
 
 		 324 aa  207  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000219456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03985  WD-40 repeat protein  37.59 
 
 		 320 aa  206  6e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00637203  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0436  hypothetical protein  35.6 
 
 		 327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002291  hypothetical protein  33.54 
 
 		 328 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000281233  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0304  putative lipoprotein  31.33 
 
 		 338 aa  169  4e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.404222  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00063  hypothetical protein  32.7 
 
 		 328 aa  169  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2764  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0763  WD-40 repeat-containing protein  28.22 
 
 		 327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0588  WD-40 repeat-containing protein  26.91 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3925  WD-40 repeat-containing protein  26.79 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4706  putative lipoprotein  29.23 
 
 		 326 aa  122  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3587  hypothetical protein  26.03 
 
 		 328 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000116276  normal  0.305585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  28.86 
 
 		 1454 aa  86.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3483  WD-40 repeat-containing protein  23.05 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3169  WD-40 repeat-containing protein  22.73 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  26.76 
 
 		 1510 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  30.16 
 
 		 1163 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  26.47 
 
 		 1217 aa  77  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.32 
 
 		 1481 aa  75.9  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  26.13 
 
 		 1229 aa  74.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  28.08 
 
 		 1523 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  27.99 
 
 		 1211 aa  73.9  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  26.01 
 
 		 947 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.14 
 
 		 1364 aa  73.6  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  30.42 
 
 		 696 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  27.72 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  29.71 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.21 
 
 		 1557 aa  69.3  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  26.74 
 
 		 1553 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  27.64 
 
 		 1190 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  26.75 
 
 		 578 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.13 
 
 		 630 aa  66.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.84 
 
 		 682 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  29.77 
 
 		 1188 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 1221 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  30.97 
 
 		 790 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  25.31 
 
 		 774 aa  64.3  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  27.4 
 
 		 1474 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  28.04 
 
 		 1280 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.95 
 
 		 1363 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  26.64 
 
 		 778 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  24.9 
 
 		 464 aa  63.5  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  32.2 
 
 		 742 aa  63.2  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  27.31 
 
 		 1807 aa  62.8  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3437  WD-40 repeat protein  27.87 
 
 		 1160 aa  62.4  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.67443  normal  0.247289 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.56 
 
 		 677 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  27.34 
 
 		 1357 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  28.69 
 
 		 1878 aa  60.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  24.7 
 
 		 589 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  27.94 
 
 		 1242 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  35.83 
 
 		 954 aa  60.1  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.03 
 
 		 919 aa  60.1  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.8 
 
 		 608 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.19 
 
 		 1868 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  25.81 
 
 		 1484 aa  60.1  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  29.07 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  27.35 
 
 		 1214 aa  59.3  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  26.02 
 
 		 1411 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  28.1 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  22.03 
 
 		 657 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.24 
 
 		 930 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.12 
 
 		 675 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  28.42 
 
 		 687 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0977  WD-40 repeat-containing protein  26.51 
 
 		 580 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.121052  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0958  WD-40 repeat-containing protein  26.51 
 
 		 580 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1367 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.29 
 
 		 676 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  27.6 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.19 
 
 		 1652 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.18 
 
 		 692 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.29 
 
 		 664 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.61 
 
 		 792 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  27.72 
 
 		 564 aa  56.6  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.71 
 
 		 1240 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.87 
 
 		 576 aa  56.2  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  27.51 
 
 		 1656 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34219  predicted protein  27.45 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.665929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  28.73 
 
 		 1330 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2183  WD-40 repeat protein  30.65 
 
 		 772 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  28.75 
 
 		 1858 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.46 
 
 		 1205 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2135  WD-40 repeat protein  30.65 
 
 		 772 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.54 
 
 		 642 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.57 
 
 		 1760 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  23.78 
 
 		 1901 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>