181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0967 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0967  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 319 aa  649    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000101779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0917  WD-40 repeat-containing protein  76.49 
 
 		 319 aa  500  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000268959  normal  0.0477605 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3011  WD-40 repeat-containing protein  60.19 
 
 		 316 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000211849  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3399  WD-40 repeat protein  58.92 
 
 		 316 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857088  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1064  hypothetical protein  59.24 
 
 		 316 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3597  WD-40 repeat-containing protein  58.6 
 
 		 316 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000016405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3035  WD-40 repeat-containing protein  58.28 
 
 		 316 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000963401  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0939  WD-40 repeat-containing protein  58.28 
 
 		 316 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000121304  normal  0.0978141 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0902  WD-40 repeat-containing protein  58.6 
 
 		 316 aa  375  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0888  WD-40 repeat-containing protein  58.92 
 
 		 316 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000055651  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3474  WD-40 repeat-containing protein  58.6 
 
 		 316 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000147643  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0839  WD-40 repeat-containing protein  58.52 
 
 		 322 aa  360  2e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000151592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3239  WD-40 repeat-containing protein  52.02 
 
 		 322 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000819869  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2910  WD-40 repeat-containing protein  50.63 
 
 		 318 aa  309  5e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000305782  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0641  hypothetical protein  49.21 
 
 		 325 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000056191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0109  WD-40 repeat-containing protein  38.97 
 
 		 324 aa  206  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000219456  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0436  hypothetical protein  36.56 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03985  WD-40 repeat protein  37.5 
 
 		 320 aa  196  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00637203  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002291  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  175  9e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000281233  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00063  hypothetical protein  33.02 
 
 		 328 aa  168  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0304  putative lipoprotein  32.63 
 
 		 338 aa  165  6.9999999999999995e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.404222  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2764  putative lipoprotein  33.23 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3587  hypothetical protein  26.75 
 
 		 328 aa  129  8.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000116276  normal  0.305585 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4706  putative lipoprotein  29.97 
 
 		 326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0763  WD-40 repeat-containing protein  28.12 
 
 		 327 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3925  WD-40 repeat-containing protein  26.85 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0588  WD-40 repeat-containing protein  24.84 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3483  WD-40 repeat-containing protein  23.49 
 
 		 354 aa  99  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3169  WD-40 repeat-containing protein  24.34 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  27.64 
 
 		 1363 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.96 
 
 		 1481 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  31.27 
 
 		 696 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.57 
 
 		 1868 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  30 
 
 		 1188 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.49 
 
 		 1557 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  23.33 
 
 		 1097 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  25.4 
 
 		 774 aa  64.7  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  26.5 
 
 		 1454 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  26.79 
 
 		 1510 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.82 
 
 		 664 aa  62.8  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  25.91 
 
 		 1229 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25 
 
 		 930 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  25.2 
 
 		 778 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  25.79 
 
 		 1247 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.85 
 
 		 1364 aa  60.8  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  22.85 
 
 		 1367 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  25.63 
 
 		 1242 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  26.24 
 
 		 1553 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.04 
 
 		 1163 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  28.08 
 
 		 1214 aa  59.7  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.1 
 
 		 1652 aa  59.3  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  26.67 
 
 		 1484 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  27.43 
 
 		 1211 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.7 
 
 		 596 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  25.45 
 
 		 1807 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  27.81 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  21.46 
 
 		 1416 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.88 
 
 		 1856 aa  57.4  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  28.11 
 
 		 1236 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.55 
 
 		 682 aa  56.2  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1474 aa  56.2  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  24.63 
 
 		 564 aa  55.8  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  29.26 
 
 		 316 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  23.6 
 
 		 1161 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  27.81 
 
 		 1443 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  24.4 
 
 		 1523 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  23.6 
 
 		 1161 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  25.71 
 
 		 947 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  26.37 
 
 		 316 aa  54.3  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.76 
 
 		 1205 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  22.84 
 
 		 574 aa  53.9  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01270  cytoplasm protein, putative  25.39 
 
 		 314 aa  53.9  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00000980241  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  25.07 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  27.63 
 
 		 1188 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  28.3 
 
 		 1477 aa  53.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29215  predicted protein  21.45 
 
 		 317 aa  52.8  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.34 
 
 		 1686 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  23.43 
 
 		 578 aa  52.8  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.25 
 
 		 1823 aa  52.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  22.12 
 
 		 1190 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00230  U5 snRNP-specific 40 kDa protein, putative  24.81 
 
 		 374 aa  52  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.718611  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  28.24 
 
 		 443 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3437  WD-40 repeat protein  23.9 
 
 		 1160 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.67443  normal  0.247289 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_19794  Receptor of activated protein kinase C 1A, component of 40S small ribosomal subunit  25.29 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48240  Receptor of activated protein kinase C 1B, component of 40S small ribosomal subunit  25.29 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.164071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  26.06 
 
 		 1330 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  28.16 
 
 		 1217 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  26.56 
 
 		 346 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  25.5 
 
 		 1196 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  24.43 
 
 		 1190 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23077  predicted protein  24.48 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  28.67 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.57 
 
 		 1398 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  25.41 
 
 		 657 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  24.28 
 
 		 316 aa  51.2  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  25.11 
 
 		 1552 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  29.41 
 
 		 1280 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  25.43 
 
 		 317 aa  50.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  23.19 
 
 		 437 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  23.9 
 
 		 1411 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>