217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4706 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4706  putative lipoprotein  100 
 
 		 326 aa  660    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0109  WD-40 repeat-containing protein  32.26 
 
 		 324 aa  153  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000219456  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002291  hypothetical protein  29.51 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000281233  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0304  putative lipoprotein  34.03 
 
 		 338 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.404222  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2764  putative lipoprotein  29.01 
 
 		 327 aa  145  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00063  hypothetical protein  28.05 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03985  WD-40 repeat protein  29.39 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00637203  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1064  hypothetical protein  29.23 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0939  WD-40 repeat-containing protein  29.93 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000121304  normal  0.0978141 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0436  hypothetical protein  30.42 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0967  WD-40 repeat-containing protein  29.97 
 
 		 319 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000101779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0839  WD-40 repeat-containing protein  31.97 
 
 		 322 aa  126  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000151592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0902  WD-40 repeat-containing protein  28.52 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3399  WD-40 repeat protein  27.69 
 
 		 316 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3474  WD-40 repeat-containing protein  27.69 
 
 		 316 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000147643  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0888  WD-40 repeat-containing protein  27.69 
 
 		 316 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000055651  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3011  WD-40 repeat-containing protein  27.69 
 
 		 316 aa  122  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000211849  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3239  WD-40 repeat-containing protein  27.71 
 
 		 322 aa  122  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000819869  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3035  WD-40 repeat-containing protein  29.23 
 
 		 316 aa  122  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000963401  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3597  WD-40 repeat-containing protein  27.38 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000016405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2910  WD-40 repeat-containing protein  29.91 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000305782  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3587  hypothetical protein  27.18 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000116276  normal  0.305585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0917  WD-40 repeat-containing protein  28.82 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000268959  normal  0.0477605 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0641  hypothetical protein  28.44 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000056191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3925  WD-40 repeat-containing protein  25.16 
 
 		 332 aa  99  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  29.11 
 
 		 1553 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0588  WD-40 repeat-containing protein  23.34 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.24 
 
 		 1481 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  31.12 
 
 		 1510 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1367 aa  82.8  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25 
 
 		 930 aa  82.4  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3483  WD-40 repeat-containing protein  22.07 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3169  WD-40 repeat-containing protein  23.34 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0763  WD-40 repeat-containing protein  23.21 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  25.32 
 
 		 774 aa  77.8  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  30.74 
 
 		 1164 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.65 
 
 		 842 aa  73.9  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.04 
 
 		 1363 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.68 
 
 		 1760 aa  72.8  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  24.58 
 
 		 696 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.36 
 
 		 1163 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  25.79 
 
 		 1454 aa  70.5  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.06 
 
 		 1823 aa  68.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  29.49 
 
 		 1229 aa  66.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  28.24 
 
 		 1211 aa  66.6  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.3 
 
 		 1599 aa  66.2  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  30.77 
 
 		 1242 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  26.54 
 
 		 947 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  28.86 
 
 		 778 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 1221 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.72 
 
 		 740 aa  64.3  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.71 
 
 		 675 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  24.88 
 
 		 1280 aa  63.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.51 
 
 		 1652 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.4 
 
 		 1686 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  22.89 
 
 		 1161 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  29.26 
 
 		 443 aa  62.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  25.64 
 
 		 578 aa  62.4  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  27.11 
 
 		 1214 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3437  WD-40 repeat protein  25.38 
 
 		 1160 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.67443  normal  0.247289 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  25.4 
 
 		 1236 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  23.36 
 
 		 344 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  26.47 
 
 		 1311 aa  61.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  26.14 
 
 		 1484 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.26 
 
 		 1267 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  22.59 
 
 		 1161 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  26.17 
 
 		 1552 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  25.76 
 
 		 1196 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  26.2 
 
 		 1491 aa  60.1  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.47 
 
 		 1868 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  23.1 
 
 		 1357 aa  59.7  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.35 
 
 		 1856 aa  59.3  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1657 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  22.07 
 
 		 1523 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  25.68 
 
 		 1188 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.77 
 
 		 1711 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.37 
 
 		 1205 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  24.49 
 
 		 565 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.11 
 
 		 1262 aa  57.4  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  29.03 
 
 		 1477 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  28.16 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3932  WD-40 repeat-containing protein  25.27 
 
 		 914 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237365  unclonable  0.0000634097 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  25.37 
 
 		 1364 aa  56.6  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  24.4 
 
 		 1188 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  27.22 
 
 		 657 aa  56.6  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  22 
 
 		 1304 aa  56.2  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.62 
 
 		 1583 aa  55.8  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.64 
 
 		 1684 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  28.32 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  31.93 
 
 		 1247 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.79 
 
 		 608 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.59 
 
 		 630 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  21.6 
 
 		 919 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  23.81 
 
 		 1193 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.18 
 
 		 1623 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  21.53 
 
 		 316 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  27.85 
 
 		 1656 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  24.62 
 
 		 1097 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.44 
 
 		 664 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  22.94 
 
 		 1209 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>