94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3483 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3483  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 354 aa  718    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0588  WD-40 repeat-containing protein  47.04 
 
 		 313 aa  292  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3925  WD-40 repeat-containing protein  40.62 
 
 		 332 aa  275  7e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3169  WD-40 repeat-containing protein  46.2 
 
 		 332 aa  243  3e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0917  WD-40 repeat-containing protein  25.53 
 
 		 319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000268959  normal  0.0477605 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0436  hypothetical protein  25.38 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03985  WD-40 repeat protein  25.68 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00637203  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0967  WD-40 repeat-containing protein  23.12 
 
 		 319 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000101779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2910  WD-40 repeat-containing protein  25.67 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000305782  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0109  WD-40 repeat-containing protein  25.08 
 
 		 324 aa  99  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000219456  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3239  WD-40 repeat-containing protein  24.19 
 
 		 322 aa  96.7  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000819869  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0839  WD-40 repeat-containing protein  24.19 
 
 		 322 aa  94.4  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000151592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0939  WD-40 repeat-containing protein  23.26 
 
 		 316 aa  86.7  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000121304  normal  0.0978141 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3035  WD-40 repeat-containing protein  23.05 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000963401  normal  0.459897 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1064  hypothetical protein  22.18 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0902  WD-40 repeat-containing protein  22.19 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0888  WD-40 repeat-containing protein  21.5 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000055651  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3399  WD-40 repeat protein  21.5 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2764  putative lipoprotein  23.39 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4706  putative lipoprotein  22.07 
 
 		 326 aa  80.1  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3597  WD-40 repeat-containing protein  22.18 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000016405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00063  hypothetical protein  23.7 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3474  WD-40 repeat-containing protein  22.18 
 
 		 316 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000147643  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3011  WD-40 repeat-containing protein  21.82 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000211849  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002291  hypothetical protein  22.22 
 
 		 328 aa  76.6  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000281233  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0304  putative lipoprotein  21.2 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.404222  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0641  hypothetical protein  23.24 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000056191  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02290  pre-mRNA splicing factor, putative  23.41 
 
 		 615 aa  65.1  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  27.08 
 
 		 1477 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3255  WD-40 repeat-containing protein  25.7 
 
 		 366 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0515461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  25 
 
 		 1280 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  23.66 
 
 		 1330 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.16 
 
 		 1856 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  22.92 
 
 		 1211 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  21.11 
 
 		 1161 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  21.11 
 
 		 1161 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.26 
 
 		 930 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.23 
 
 		 1823 aa  53.5  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  24.16 
 
 		 1214 aa  52.8  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.31 
 
 		 1481 aa  52.8  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  23.08 
 
 		 1831 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  23.81 
 
 		 1807 aa  51.6  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  23.29 
 
 		 1443 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  25.1 
 
 		 1901 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  26.71 
 
 		 1242 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  23.23 
 
 		 1364 aa  50.1  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25 
 
 		 1599 aa  50.4  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  20.14 
 
 		 1164 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  21.65 
 
 		 1510 aa  49.7  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  26.85 
 
 		 1217 aa  49.7  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04771  ribosomal assembly complex component Ipi3, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06580)  28.4 
 
 		 573 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.855526  normal  0.61445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25.17 
 
 		 696 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3455  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.54 
 
 		 1205 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.02414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  20.49 
 
 		 505 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  23.28 
 
 		 316 aa  48.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54743  predicted protein  20.89 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0297675  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  26.83 
 
 		 742 aa  47.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1339  WD-40 repeat-containing protein  25.15 
 
 		 504 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143259  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  23.24 
 
 		 464 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  22.59 
 
 		 1553 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15280  predicted protein  26.06 
 
 		 534 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  24.62 
 
 		 1097 aa  47.4  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.37 
 
 		 842 aa  46.6  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_23077  predicted protein  24.38 
 
 		 379 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.182131  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  21.79 
 
 		 1016 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05196  mRNA splicing factor (Prp17), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G07300)  21.94 
 
 		 531 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.202062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  21.65 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  20.34 
 
 		 1247 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  21.36 
 
 		 1454 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  21.79 
 
 		 1016 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.49 
 
 		 642 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  21.94 
 
 		 317 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3587  hypothetical protein  22.75 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000116276  normal  0.305585 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  27.27 
 
 		 1484 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2440  WD-40 repeat-containing protein  23.25 
 
 		 433 aa  45.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00410064  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  23.36 
 
 		 1190 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  19.26 
 
 		 1311 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  26.94 
 
 		 565 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  21.39 
 
 		 1213 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  19.73 
 
 		 1523 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3437  WD-40 repeat protein  25 
 
 		 1160 aa  43.5  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.67443  normal  0.247289 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  20.14 
 
 		 1363 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  24.62 
 
 		 1416 aa  43.5  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.38 
 
 		 698 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35708  predicted protein  24.12 
 
 		 678 aa  43.5  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.155521 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5500  cytochrome c class I  22.37 
 
 		 431 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  20.81 
 
 		 947 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1253  WD-40 repeat protein  21.4 
 
 		 960 aa  43.5  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  22.33 
 
 		 943 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  21.03 
 
 		 1262 aa  43.1  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_17027  predicted protein  23.04 
 
 		 500 aa  43.1  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.625475  normal  0.0184587 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.84 
 
 		 1868 aa  42.7  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  23.86 
 
 		 1208 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32777  predicted protein  21.13 
 
 		 461 aa  42.7  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.535104  normal  0.359872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>