27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2877 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2877  WD40 repeat, subgroup  100 
 
 		 380 aa  767    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.01664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2616  WD40 repeat, subgroup  41.86 
 
 		 145 aa  93.2  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173979  normal  0.948356 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  23.4 
 
 		 1682 aa  84  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  24.24 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  23.93 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  23.49 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  23.78 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  22.5 
 
 		 486 aa  72.4  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  25.15 
 
 		 1161 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  25.15 
 
 		 1161 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  21.93 
 
 		 2122 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  24.53 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  25.43 
 
 		 460 aa  56.6  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2728  hypothetical protein  25.26 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.402886 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  21.97 
 
 		 1714 aa  53.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  23.81 
 
 		 1552 aa  53.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  27.82 
 
 		 1416 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  21.43 
 
 		 546 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1290  Pyrrolo-quinoline quinone  26.11 
 
 		 442 aa  51.2  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366106  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  21.29 
 
 		 1789 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  26.07 
 
 		 450 aa  47.4  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  22.42 
 
 		 1599 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  25.31 
 
 		 352 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.26 
 
 		 1711 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  33.63 
 
 		 415 aa  43.5  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.59 
 
 		 1481 aa  42.7  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.01 
 
 		 1383 aa  42.7  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>