114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1290 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1290  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 442 aa  904    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366106  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  30.27 
 
 		 963 aa  100  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  28.52 
 
 		 431 aa  91.3  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  27.03 
 
 		 463 aa  87.4  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  28.52 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  25.49 
 
 		 795 aa  82.4  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  30.97 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  26.09 
 
 		 901 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  26.79 
 
 		 432 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  26.95 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  28.52 
 
 		 1416 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  28.74 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3251  serine/threonine protein kinase  25.83 
 
 		 861 aa  65.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0225262 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  25.86 
 
 		 484 aa  64.3  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  24.65 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  25.69 
 
 		 371 aa  63.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  22.52 
 
 		 445 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_5471  predicted protein  24.21 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  28.48 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  29.67 
 
 		 790 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  26.26 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  26.48 
 
 		 577 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  24.6 
 
 		 1427 aa  57.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  25.77 
 
 		 1163 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  22.26 
 
 		 687 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  25.36 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  26.6 
 
 		 365 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  23.83 
 
 		 774 aa  57  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  26.27 
 
 		 316 aa  57  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  28.57 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  27.08 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  24.05 
 
 		 1364 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  26.58 
 
 		 316 aa  56.2  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  26.46 
 
 		 696 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  26.94 
 
 		 335 aa  55.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  25.81 
 
 		 439 aa  55.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  29.39 
 
 		 1454 aa  54.7  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.18 
 
 		 1039 aa  53.5  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  23.41 
 
 		 705 aa  53.5  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  32.81 
 
 		 1041 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  26.64 
 
 		 1443 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  23.64 
 
 		 1363 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  25.58 
 
 		 1193 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  23.55 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  22.34 
 
 		 616 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  23.35 
 
 		 407 aa  51.6  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  27.39 
 
 		 455 aa  50.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2734  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25 
 
 		 393 aa  50.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  33.08 
 
 		 469 aa  50.4  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2362  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.86 
 
 		 395 aa  50.1  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.034876  normal  0.596671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  21.89 
 
 		 652 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2069  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  35.87 
 
 		 407 aa  50.1  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  23.4 
 
 		 1474 aa  50.1  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  22.85 
 
 		 1523 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  24.73 
 
 		 742 aa  49.7  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3214  Pyrrolo-quinoline quinone  25.86 
 
 		 349 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000613548  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67807  F box protein, for ubiquitin- dependent degradation  25.81 
 
 		 780 aa  48.9  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1435  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.12 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00436536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  25.97 
 
 		 317 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  24.24 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  24.43 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  24.43 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1121  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  23.56 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  25.35 
 
 		 457 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2728  hypothetical protein  27.47 
 
 		 384 aa  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.402886 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  27.1 
 
 		 809 aa  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1231  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.37 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1302  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.37 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1232  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.37 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  26.13 
 
 		 1807 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.18 
 
 		 1267 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  29 
 
 		 438 aa  47.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2538  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.57 
 
 		 381 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0468312  hitchhiker  0.00031384 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3733  Pyrrolo-quinoline quinone  30.84 
 
 		 562 aa  47.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2877  WD40 repeat, subgroup  26.11 
 
 		 380 aa  47.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.01664  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0779  methanol dehydrogenase protein, large subunit  32.94 
 
 		 601 aa  47.4  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0879687  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2374  Pyrrolo-quinoline quinone  24.68 
 
 		 450 aa  47.4  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.145531  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  29.57 
 
 		 386 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  29.78 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25 
 
 		 392 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25 
 
 		 392 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  24.01 
 
 		 344 aa  47  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1729  Pyrrolo-quinoline quinone  24.68 
 
 		 372 aa  47  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  25.19 
 
 		 1229 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  24.7 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1384  Pyrrolo-quinoline quinone  19.93 
 
 		 612 aa  45.8  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.868816  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  33.98 
 
 		 611 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03060  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  28.92 
 
 		 473 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.212219  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.15 
 
 		 1557 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2890  Pyrrolo-quinoline quinone  23.31 
 
 		 583 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.612512  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  22.82 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  25.7 
 
 		 505 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 1221 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  25.77 
 
 		 363 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0427  Pyrrolo-quinoline quinone  26.22 
 
 		 706 aa  44.7  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.196079 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2227  Pyrrolo-quinoline quinone  24.64 
 
 		 705 aa  45.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  21.86 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  25.22 
 
 		 1280 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  27.12 
 
 		 445 aa  44.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1202  Pyrrolo-quinoline quinone  24.88 
 
 		 458 aa  44.3  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.549176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>