85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2728 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2728  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  774    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.402886 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2616  WD40 repeat, subgroup  40.98 
 
 		 145 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173979  normal  0.948356 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  27.21 
 
 		 1523 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  27.08 
 
 		 2122 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2877  WD40 repeat, subgroup  25.27 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.01664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  27.84 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  25.09 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  27.11 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  24.46 
 
 		 1454 aa  60.1  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.51 
 
 		 1240 aa  59.7  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  26.94 
 
 		 1364 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25.3 
 
 		 696 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  26.24 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  26.38 
 
 		 546 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  27.47 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3390  hypothetical protein  24.42 
 
 		 487 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000496951  normal  0.136227 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 1557 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  26.72 
 
 		 1416 aa  54.7  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  25.17 
 
 		 1789 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  28.5 
 
 		 352 aa  54.3  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  25 
 
 		 1682 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  27.14 
 
 		 790 aa  53.5  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  31.17 
 
 		 1357 aa  53.5  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  22.32 
 
 		 1190 aa  53.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  25.17 
 
 		 1163 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  22.77 
 
 		 1363 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.33 
 
 		 676 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  27.09 
 
 		 1652 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  28.97 
 
 		 1842 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  27.44 
 
 		 456 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  27.88 
 
 		 460 aa  50.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.21 
 
 		 677 aa  50.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  29.58 
 
 		 589 aa  50.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  25.45 
 
 		 1477 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  23.6 
 
 		 1177 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.1 
 
 		 1711 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 		 1229 aa  49.7  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.72 
 
 		 608 aa  49.7  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  28.38 
 
 		 432 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.91 
 
 		 642 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  24.74 
 
 		 1553 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1290  Pyrrolo-quinoline quinone  27.16 
 
 		 442 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366106  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  24 
 
 		 1656 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  28.96 
 
 		 778 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.44 
 
 		 664 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  22.08 
 
 		 1552 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  25.35 
 
 		 728 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.57 
 
 		 1760 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  22.77 
 
 		 437 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0693  WD-40 repeat protein  22.9 
 
 		 363 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00188435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.99 
 
 		 1039 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  24.79 
 
 		 1214 aa  47  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  25.48 
 
 		 1188 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0674  WD-40 repeat protein  22.9 
 
 		 363 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  28.1 
 
 		 344 aa  47  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  22.76 
 
 		 1510 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  24.22 
 
 		 1474 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  28.67 
 
 		 344 aa  46.6  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  24.91 
 
 		 1211 aa  46.6  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.28 
 
 		 842 aa  46.6  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  22.59 
 
 		 947 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  21.94 
 
 		 1161 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  21.94 
 
 		 1161 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  29.68 
 
 		 486 aa  46.2  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  25.12 
 
 		 657 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.53 
 
 		 1609 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11281  WD-40 repeat-containing G-protein  22.69 
 
 		 357 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  24.8 
 
 		 564 aa  44.3  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  26.92 
 
 		 742 aa  44.3  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.58 
 
 		 740 aa  44.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.15 
 
 		 630 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_006686  CND03830  conserved hypothetical protein  24.79 
 
 		 343 aa  44.3  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  22.11 
 
 		 1242 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2440  WD-40 repeat-containing protein  26.09 
 
 		 433 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00410064  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  24.83 
 
 		 346 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.52 
 
 		 682 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.05 
 
 		 1617 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  24.91 
 
 		 1411 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  21.1 
 
 		 1348 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  25.41 
 
 		 434 aa  43.5  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 1221 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.32 
 
 		 692 aa  43.1  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  25.58 
 
 		 1176 aa  43.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.09 
 
 		 1262 aa  43.1  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  23.7 
 
 		 1164 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>