272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_11281 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_11281  WD-40 repeat-containing G-protein  100 
 
 
357 aa  733    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  82.63 
 
 
357 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1045  WD-40 repeat-containing protein  82.35 
 
 
357 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  82.35 
 
 
357 aa  618  1e-176  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1038  WD-40 repeat-containing protein  69.94 
 
 
357 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19081  WD-40 repeat-containing G-protein  69.75 
 
 
358 aa  528  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.352529  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15191  WD-40 repeat-containing G-protein  68.41 
 
 
345 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11171  WD-40 repeat-containing G-protein  59.55 
 
 
357 aa  451  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.194374 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1305  WD-40 repeat-containing protein  31.86 
 
 
348 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.461181  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1713  WD-40 repeat-containing protein  29.09 
 
 
367 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0610  WD-40 repeat protein  30.84 
 
 
349 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.520879  normal  0.0413859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1390  WD-40 repeat protein  31.97 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0550315  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3116  WD-40 repeat-containing protein  31.71 
 
 
335 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2336  WD-40 repeat-containing protein  29.68 
 
 
335 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173512  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3020  WD-40 repeat protein  28.73 
 
 
332 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0862  WD-40 repeat-containing protein  29.55 
 
 
337 aa  102  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13548  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2615  WD-40 repeat protein  29.33 
 
 
335 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.023853 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  28.52 
 
 
1357 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2841  hypothetical protein  29.23 
 
 
324 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0918  WD-40 repeat-containing protein  29.41 
 
 
337 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0930  WD-40 repeat protein  29.23 
 
 
339 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2768  WD-40 repeat-containing protein  29.37 
 
 
329 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1372  WD repeat-containing protein  27.38 
 
 
324 aa  100  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.823736  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0199  WD-40 repeat-containing protein  30.08 
 
 
340 aa  99.8  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0246963  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0847  WD-40 repeat-containing protein  30.65 
 
 
339 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.135434 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0948  WD repeat-containing protein  29.53 
 
 
340 aa  99  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2291  WD-40 repeat protein  29.82 
 
 
335 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5186  WD40 domain-containing protein  26.44 
 
 
346 aa  97.4  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3424  hypothetical protein  26.94 
 
 
338 aa  96.7  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0709328  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0091  WD-40 repeat-containing protein  29.63 
 
 
337 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2131  WD-40 repeat-containing protein  29.89 
 
 
343 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225533  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4555  WD-40 repeat-containing protein  28.81 
 
 
339 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.999711  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0930  ATP/GTP-binding motif-containing protein  26.17 
 
 
324 aa  94  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0988  WD repeat-containing protein  26.17 
 
 
324 aa  93.6  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  26.51 
 
 
1831 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4832  WD-40 repeat-containing protein  28.51 
 
 
344 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224908  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1343  hypothetical protein  27.92 
 
 
339 aa  90.1  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808719  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  24.56 
 
 
696 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  26.64 
 
 
1714 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3683  WD-40 repeat protein  27.65 
 
 
329 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925722  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3385  hypothetical protein  28.14 
 
 
329 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1908  WD-40 repeat protein  25 
 
 
365 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  28.04 
 
 
742 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  29.21 
 
 
335 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.03 
 
 
642 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  24.68 
 
 
1858 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  23.86 
 
 
1510 aa  83.6  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  28.26 
 
 
1236 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.4 
 
 
1652 aa  83.2  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3798  hypothetical protein  26.93 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.599459  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0286  WD-40 repeat-containing protein  24.65 
 
 
386 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.639022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  27.03 
 
 
1217 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.21 
 
 
1481 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.18 
 
 
1760 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.61 
 
 
1609 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  24.91 
 
 
1553 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  25.26 
 
 
947 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  27.57 
 
 
1363 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  29.63 
 
 
1163 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.04 
 
 
919 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  24.56 
 
 
1789 aa  80.5  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.26 
 
 
1711 aa  80.5  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.48 
 
 
1686 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  28.35 
 
 
1477 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.33 
 
 
740 aa  77  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  24.49 
 
 
1193 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  24.18 
 
 
1661 aa  76.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3190  WD-40 repeat protein  25.35 
 
 
358 aa  76.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  25.47 
 
 
1100 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0863  WD-40 repeat protein  23.99 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.16 
 
 
737 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  25.27 
 
 
1213 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  25.17 
 
 
1304 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  27.24 
 
 
1190 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.92 
 
 
1583 aa  73.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  27.89 
 
 
1221 aa  73.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  25.09 
 
 
565 aa  73.6  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0889  WD-40 repeat protein  23.68 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  26.47 
 
 
1901 aa  72.8  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.9 
 
 
675 aa  72.8  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  25.2 
 
 
1188 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.73 
 
 
1262 aa  72.8  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  23.39 
 
 
1364 aa  72  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  25.17 
 
 
344 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.39 
 
 
622 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  24.6 
 
 
344 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  24.84 
 
 
1209 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  25.26 
 
 
346 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  27.6 
 
 
1552 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  26.94 
 
 
1474 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  24.8 
 
 
1164 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  25.69 
 
 
1443 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  25 
 
 
608 aa  70.1  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  25.74 
 
 
1161 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  24.48 
 
 
464 aa  69.7  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.55 
 
 
1557 aa  69.3  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  26.18 
 
 
1656 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.33 
 
 
1626 aa  69.3  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  22.42 
 
 
1523 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  25.74 
 
 
1161 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>