282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0863 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0863  WD-40 repeat protein  100 
 
 
358 aa  724    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0889  WD-40 repeat protein  99.44 
 
 
358 aa  721    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3190  WD-40 repeat protein  53.35 
 
 
358 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5186  WD40 domain-containing protein  46.18 
 
 
346 aa  299  5e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0286  WD-40 repeat-containing protein  44.85 
 
 
386 aa  297  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.639022 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1908  WD-40 repeat protein  43.91 
 
 
365 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  28.82 
 
 
1831 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11171  WD-40 repeat-containing G-protein  29.75 
 
 
357 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.194374 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1038  WD-40 repeat-containing protein  26.4 
 
 
357 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2336  WD-40 repeat-containing protein  28.62 
 
 
335 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173512  normal  0.936948 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  27.98 
 
 
1364 aa  97.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2615  WD-40 repeat protein  28.62 
 
 
335 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.023853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1390  WD-40 repeat protein  28.16 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0550315  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19081  WD-40 repeat-containing G-protein  26.1 
 
 
358 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.352529  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1713  WD-40 repeat-containing protein  25.61 
 
 
367 aa  96.3  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2291  WD-40 repeat protein  28.27 
 
 
335 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0862  WD-40 repeat-containing protein  28.78 
 
 
337 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13548  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.52 
 
 
1652 aa  90.1  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  28.7 
 
 
1221 aa  89.7  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15191  WD-40 repeat-containing G-protein  27.55 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3020  WD-40 repeat protein  28.42 
 
 
332 aa  87.4  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  24.62 
 
 
1443 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  28.17 
 
 
1807 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0091  WD-40 repeat-containing protein  27.92 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4555  WD-40 repeat-containing protein  25.72 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.999711  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.44 
 
 
740 aa  83.2  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4832  WD-40 repeat-containing protein  24.61 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224908  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  24.25 
 
 
357 aa  83.2  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.15 
 
 
1363 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0918  WD-40 repeat-containing protein  26.06 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1045  WD-40 repeat-containing protein  23.55 
 
 
357 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2131  WD-40 repeat-containing protein  23.86 
 
 
343 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225533  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  24.12 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  28.74 
 
 
696 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  24.44 
 
 
1789 aa  80.1  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  29.62 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0199  WD-40 repeat-containing protein  28.34 
 
 
340 aa  79.3  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0246963  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  25.08 
 
 
1348 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0930  WD-40 repeat protein  24.84 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  26.62 
 
 
1209 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  25.87 
 
 
1901 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  22.34 
 
 
919 aa  77  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  24.37 
 
 
1878 aa  76.6  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3424  hypothetical protein  24.76 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0709328  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  26.16 
 
 
464 aa  76.3  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  27.04 
 
 
565 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0948  WD repeat-containing protein  24.06 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.66 
 
 
1760 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.73 
 
 
676 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  23.44 
 
 
1714 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  23.46 
 
 
1491 aa  75.5  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2841  hypothetical protein  25.09 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11281  WD-40 repeat-containing G-protein  23.99 
 
 
357 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.34 
 
 
1686 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3116  WD-40 repeat-containing protein  25.16 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  27.54 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  23.84 
 
 
1176 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0847  WD-40 repeat-containing protein  25.44 
 
 
339 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.135434 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.6 
 
 
1481 aa  73.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  24.05 
 
 
947 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  23.32 
 
 
1236 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.37 
 
 
1262 aa  72.4  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  24.46 
 
 
1190 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0547  WD-40 repeat protein  26.26 
 
 
477 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  25.86 
 
 
1193 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.53 
 
 
924 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  26.34 
 
 
540 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.32 
 
 
737 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  23.3 
 
 
1599 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0988  WD repeat-containing protein  25.43 
 
 
324 aa  71.2  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0930  ATP/GTP-binding motif-containing protein  25.52 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.87 
 
 
630 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  24.05 
 
 
1474 aa  70.5  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.45 
 
 
642 aa  70.1  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1305  WD-40 repeat-containing protein  24.85 
 
 
348 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.461181  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.59 
 
 
1163 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.74 
 
 
622 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  29.3 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1343  hypothetical protein  25.32 
 
 
339 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808719  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  23.53 
 
 
1247 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  25.53 
 
 
1661 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  24.09 
 
 
1552 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  22.96 
 
 
1164 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.56 
 
 
675 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.13 
 
 
677 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  24.07 
 
 
1304 aa  67.4  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0674  WD-40 repeat protein  26.02 
 
 
363 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0693  WD-40 repeat protein  26.02 
 
 
363 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00188435  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  24.17 
 
 
891 aa  66.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.05 
 
 
1599 aa  66.2  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26408  predicted protein  27.33 
 
 
516 aa  66.2  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0183976  normal  0.0137501 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  26.22 
 
 
1217 aa  65.9  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  26.05 
 
 
437 aa  66.2  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2768  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  22.19 
 
 
1161 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.06 
 
 
1240 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  25.43 
 
 
344 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  22.89 
 
 
443 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  24.28 
 
 
1656 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  26.99 
 
 
872 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>