165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0091 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0091  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 337 aa  672    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2291  WD-40 repeat protein  78.92 
 
 		 335 aa  531  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2336  WD-40 repeat-containing protein  76.13 
 
 		 335 aa  514  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173512  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2615  WD-40 repeat protein  75.83 
 
 		 335 aa  512  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.023853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1390  WD-40 repeat protein  71.34 
 
 		 337 aa  480  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0550315  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0862  WD-40 repeat-containing protein  71.34 
 
 		 337 aa  464  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3020  WD-40 repeat protein  61.09 
 
 		 332 aa  393  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3116  WD-40 repeat-containing protein  57.58 
 
 		 335 aa  378  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4555  WD-40 repeat-containing protein  50 
 
 		 339 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.999711  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4832  WD-40 repeat-containing protein  49.09 
 
 		 344 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0930  WD-40 repeat protein  50.16 
 
 		 339 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0918  WD-40 repeat-containing protein  48.01 
 
 		 337 aa  290  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0847  WD-40 repeat-containing protein  47.43 
 
 		 339 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.135434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1343  hypothetical protein  47.71 
 
 		 339 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808719  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3424  hypothetical protein  46.97 
 
 		 338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0709328  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2131  WD-40 repeat-containing protein  49.24 
 
 		 343 aa  285  9e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2841  hypothetical protein  47.08 
 
 		 324 aa  272  6e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0988  WD repeat-containing protein  46.32 
 
 		 324 aa  263  4e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3798  hypothetical protein  46.36 
 
 		 328 aa  262  6.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.599459  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0930  ATP/GTP-binding motif-containing protein  46.32 
 
 		 324 aa  262  6.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3683  WD-40 repeat protein  45.73 
 
 		 329 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925722  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1372  WD repeat-containing protein  44.79 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.823736  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3385  hypothetical protein  45.12 
 
 		 329 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2768  WD-40 repeat-containing protein  44.85 
 
 		 329 aa  248  8e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0948  WD repeat-containing protein  42.81 
 
 		 340 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0610  WD-40 repeat protein  42.75 
 
 		 349 aa  186  6e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.520879  normal  0.0413859 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1305  WD-40 repeat-containing protein  39.51 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.461181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0199  WD-40 repeat-containing protein  40.29 
 
 		 340 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0246963  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15191  WD-40 repeat-containing G-protein  29.84 
 
 		 345 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1038  WD-40 repeat-containing protein  28.74 
 
 		 357 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11281  WD-40 repeat-containing G-protein  29.63 
 
 		 357 aa  96.3  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11171  WD-40 repeat-containing G-protein  29.25 
 
 		 357 aa  95.9  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.194374 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1045  WD-40 repeat-containing protein  30.45 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19081  WD-40 repeat-containing G-protein  29.03 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.352529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  30.04 
 
 		 357 aa  92.8  7e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  30.2 
 
 		 357 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0863  WD-40 repeat protein  27.92 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0889  WD-40 repeat protein  27.56 
 
 		 358 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1713  WD-40 repeat-containing protein  32.11 
 
 		 367 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5186  WD40 domain-containing protein  29.93 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0286  WD-40 repeat-containing protein  28.41 
 
 		 386 aa  73.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.639022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3190  WD-40 repeat protein  28.02 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  26.15 
 
 		 1163 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.97 
 
 		 1363 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.43 
 
 		 1236 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1384  hypothetical protein  29.5 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1908  WD-40 repeat protein  28.52 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3865  WD-40 repeat protein  27.88 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  26.64 
 
 		 1807 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3914  WD-40 repeat protein  27.88 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152653  normal  0.245593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  29.2 
 
 		 1401 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  26.48 
 
 		 1364 aa  57  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.76 
 
 		 1652 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  23.91 
 
 		 1161 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  23.91 
 
 		 1161 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  22.64 
 
 		 1789 aa  56.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.33 
 
 		 682 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  23.45 
 
 		 1552 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3255  WD-40 repeat-containing protein  26.2 
 
 		 366 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0515461  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.48 
 
 		 1711 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  28.21 
 
 		 1190 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  28.21 
 
 		 1367 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.6 
 
 		 1760 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  26.02 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1263  WD-40 repeat protein  24.56 
 
 		 377 aa  53.9  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.75 
 
 		 1262 aa  53.5  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  26.52 
 
 		 437 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  24.78 
 
 		 1304 aa  53.1  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.1 
 
 		 676 aa  52.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  28.35 
 
 		 1344 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  23.81 
 
 		 1831 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.36 
 
 		 630 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  26.77 
 
 		 1858 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.47 
 
 		 642 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.42 
 
 		 1267 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.96 
 
 		 1072 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  26.34 
 
 		 1348 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  25.41 
 
 		 1229 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.92 
 
 		 1599 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.96 
 
 		 1072 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  22.63 
 
 		 947 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  28.17 
 
 		 696 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  25.98 
 
 		 1242 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.67 
 
 		 1623 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.53 
 
 		 842 aa  50.4  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  22.63 
 
 		 505 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  25.52 
 
 		 1196 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  25.53 
 
 		 742 aa  50.1  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.61 
 
 		 924 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  29.02 
 
 		 608 aa  49.7  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  23.89 
 
 		 1477 aa  49.7  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  26.56 
 
 		 1183 aa  49.7  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  26.6 
 
 		 790 aa  49.3  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  24.72 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.09 
 
 		 596 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.38 
 
 		 1481 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  22.97 
 
 		 1510 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21 
 
 		 622 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  26.67 
 
 		 1164 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  27.78 
 
 		 1177 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>