More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1908 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1908  WD-40 repeat protein  100 
 
 		 365 aa  734    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5186  WD40 domain-containing protein  48.55 
 
 		 346 aa  326  3e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0286  WD-40 repeat-containing protein  48.31 
 
 		 386 aa  321  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.639022 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0863  WD-40 repeat protein  43.91 
 
 		 358 aa  265  8.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0889  WD-40 repeat protein  43.63 
 
 		 358 aa  262  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3190  WD-40 repeat protein  40.78 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  30.84 
 
 		 1831 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1038  WD-40 repeat-containing protein  27.15 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1713  WD-40 repeat-containing protein  26.51 
 
 		 367 aa  99.8  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19081  WD-40 repeat-containing G-protein  26.74 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.352529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  28.07 
 
 		 1193 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  29.8 
 
 		 696 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11171  WD-40 repeat-containing G-protein  26.52 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.194374 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15191  WD-40 repeat-containing G-protein  27.45 
 
 		 345 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.71 
 
 		 1652 aa  92.8  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.76 
 
 		 1481 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  26.73 
 
 		 1364 aa  88.2  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  25.98 
 
 		 1510 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.7 
 
 		 919 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  27.03 
 
 		 1209 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11281  WD-40 repeat-containing G-protein  25 
 
 		 357 aa  86.3  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.21 
 
 		 1363 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  24.81 
 
 		 1247 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  25.4 
 
 		 357 aa  86.3  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.38 
 
 		 1163 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  25.08 
 
 		 357 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 1221 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  26.35 
 
 		 1789 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  22.41 
 
 		 947 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  24.48 
 
 		 1348 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.24 
 
 		 675 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1045  WD-40 repeat-containing protein  24.76 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  23.71 
 
 		 1858 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  27.25 
 
 		 1553 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  27.7 
 
 		 1399 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  25.21 
 
 		 1161 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  25.21 
 
 		 1161 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1305  WD-40 repeat-containing protein  28.09 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.461181  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  25.12 
 
 		 1411 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1390  WD-40 repeat protein  29.69 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0550315  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0918  WD-40 repeat-containing protein  26.84 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.61 
 
 		 1686 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4555  WD-40 repeat-containing protein  26.07 
 
 		 339 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.999711  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  26.65 
 
 		 1807 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.37 
 
 		 1760 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  25.29 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  25 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  24.58 
 
 		 1714 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  24.86 
 
 		 1236 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 1878 aa  79.7  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  26.97 
 
 		 1656 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  29.38 
 
 		 1357 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0199  WD-40 repeat-containing protein  27.05 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0246963  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  26.73 
 
 		 1661 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  30.51 
 
 		 1217 aa  77  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.13 
 
 		 1262 aa  77.4  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  24.93 
 
 		 1196 aa  77  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2615  WD-40 repeat protein  28.53 
 
 		 335 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.023853 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.12 
 
 		 1004 aa  76.6  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0930  WD-40 repeat protein  25 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  25.85 
 
 		 1443 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2336  WD-40 repeat-containing protein  28.53 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173512  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.75 
 
 		 642 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2291  WD-40 repeat protein  28.53 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  27.04 
 
 		 1208 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  27.65 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4832  WD-40 repeat-containing protein  25.65 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0862  WD-40 repeat-containing protein  29.14 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  27.46 
 
 		 1901 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  30.19 
 
 		 608 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  27.55 
 
 		 1041 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.93 
 
 		 943 aa  73.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  33.99 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  28.84 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.27 
 
 		 622 aa  73.2  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  25.53 
 
 		 1599 aa  73.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.48 
 
 		 1557 aa  73.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.58 
 
 		 1711 aa  73.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.4 
 
 		 676 aa  73.2  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3424  hypothetical protein  25.79 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0709328  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  22.61 
 
 		 1188 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  24.29 
 
 		 1264 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  24.29 
 
 		 1264 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  26.76 
 
 		 434 aa  72.8  0.000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  23.91 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  28.45 
 
 		 565 aa  72.8  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.55 
 
 		 740 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  25.93 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  24.2 
 
 		 1213 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  28.8 
 
 		 742 aa  71.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  26.72 
 
 		 1344 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0847  WD-40 repeat-containing protein  24.71 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.135434 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  25.4 
 
 		 574 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.98 
 
 		 930 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2147  WD-40 repeat-containing protein  27.27 
 
 		 589 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.631992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.71 
 
 		 677 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  24.46 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  25.68 
 
 		 1209 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  28.28 
 
 		 872 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  24.04 
 
 		 657 aa  70.1  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>