209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0862 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0862  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 337 aa  666    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1390  WD-40 repeat protein  87.83 
 
 		 337 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0550315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2291  WD-40 repeat protein  76.65 
 
 		 335 aa  513  1e-144  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2336  WD-40 repeat-containing protein  76.19 
 
 		 335 aa  509  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173512  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2615  WD-40 repeat protein  76.19 
 
 		 335 aa  510  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.023853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0091  WD-40 repeat-containing protein  71.34 
 
 		 337 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3020  WD-40 repeat protein  61.98 
 
 		 332 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3116  WD-40 repeat-containing protein  57.44 
 
 		 335 aa  386  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4555  WD-40 repeat-containing protein  54.1 
 
 		 339 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.999711  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0918  WD-40 repeat-containing protein  50.76 
 
 		 337 aa  320  3e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4832  WD-40 repeat-containing protein  52.25 
 
 		 344 aa  318  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1343  hypothetical protein  50.61 
 
 		 339 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808719  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0930  WD-40 repeat protein  52.44 
 
 		 339 aa  315  7e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0847  WD-40 repeat-containing protein  50.75 
 
 		 339 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.135434 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3424  hypothetical protein  48.25 
 
 		 338 aa  309  4e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0709328  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2131  WD-40 repeat-containing protein  49.55 
 
 		 343 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2841  hypothetical protein  49.37 
 
 		 324 aa  281  9e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0988  WD repeat-containing protein  48.43 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0930  ATP/GTP-binding motif-containing protein  48.11 
 
 		 324 aa  267  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1372  WD repeat-containing protein  47.85 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.823736  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3798  hypothetical protein  47.35 
 
 		 328 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.599459  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3683  WD-40 repeat protein  46.89 
 
 		 329 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925722  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3385  hypothetical protein  46.27 
 
 		 329 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2768  WD-40 repeat-containing protein  49.63 
 
 		 329 aa  246  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0199  WD-40 repeat-containing protein  43.4 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0246963  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0948  WD repeat-containing protein  46.01 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0610  WD-40 repeat protein  41.77 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.520879  normal  0.0413859 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1305  WD-40 repeat-containing protein  40.45 
 
 		 348 aa  189  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.461181  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1038  WD-40 repeat-containing protein  30.95 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0863  WD-40 repeat protein  29.11 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1045  WD-40 repeat-containing protein  28.34 
 
 		 357 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19081  WD-40 repeat-containing G-protein  31.23 
 
 		 358 aa  102  8e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.352529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15191  WD-40 repeat-containing G-protein  30.95 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11281  WD-40 repeat-containing G-protein  29.55 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0889  WD-40 repeat protein  28.8 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  28.03 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11171  WD-40 repeat-containing G-protein  27.68 
 
 		 357 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.194374 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  27.71 
 
 		 357 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5186  WD40 domain-containing protein  29 
 
 		 346 aa  97.8  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0286  WD-40 repeat-containing protein  28.99 
 
 		 386 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.639022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3190  WD-40 repeat protein  28.94 
 
 		 358 aa  92.8  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1713  WD-40 repeat-containing protein  29.41 
 
 		 367 aa  91.3  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1384  hypothetical protein  30.42 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1908  WD-40 repeat protein  29.45 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.98 
 
 		 1363 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  24.65 
 
 		 1789 aa  72.8  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  29.03 
 
 		 1831 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  26.44 
 
 		 1163 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  26.57 
 
 		 1236 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1511  hypothetical protein  31.48 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.338028 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.47 
 
 		 740 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  29.13 
 
 		 1552 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2789  hypothetical protein  31.85 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.70665  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  27.94 
 
 		 1364 aa  66.6  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1263  WD-40 repeat protein  28.49 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.27 
 
 		 1267 aa  63.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  27.92 
 
 		 1807 aa  62.8  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08183  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit (Pwp2), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03090)  26.15 
 
 		 851 aa  62.8  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.559435  normal  0.60601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.38 
 
 		 1760 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.68 
 
 		 1481 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  28.23 
 
 		 437 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  27.75 
 
 		 1161 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  27.75 
 
 		 1161 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  30.52 
 
 		 696 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.79 
 
 		 1599 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.09 
 
 		 1262 aa  60.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.76 
 
 		 1684 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4252  WD-40 repeat-containing protein  27.5 
 
 		 1424 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501692  normal  0.871737 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.74 
 
 		 1609 aa  59.7  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  29.39 
 
 		 1344 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.15 
 
 		 630 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  25.96 
 
 		 1553 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  26.18 
 
 		 1190 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  25.72 
 
 		 1016 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.26 
 
 		 1623 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  25.28 
 
 		 1229 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  25.72 
 
 		 1016 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  26.02 
 
 		 1100 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  29.31 
 
 		 608 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  25.1 
 
 		 1304 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  24.92 
 
 		 1510 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.76 
 
 		 642 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  29.03 
 
 		 1401 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  22.65 
 
 		 505 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  29.8 
 
 		 1901 aa  56.6  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.96 
 
 		 576 aa  56.6  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  28.02 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25 
 
 		 1607 aa  56.2  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.87 
 
 		 943 aa  56.2  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  27.48 
 
 		 1766 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.09 
 
 		 865 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.21 
 
 		 842 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  23.86 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.74 
 
 		 676 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3255  WD-40 repeat-containing protein  26.87 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0515461  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2844  WD-40 repeat-containing protein  30.07 
 
 		 440 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  23.15 
 
 		 1858 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  24.42 
 
 		 1599 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.25 
 
 		 1652 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  23.05 
 
 		 947 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>