32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1384 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1384  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  725    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2789  hypothetical protein  37.14 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.70665  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1511  hypothetical protein  36.98 
 
 		 361 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.338028 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0988  WD repeat-containing protein  29.08 
 
 		 324 aa  87.8  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0930  ATP/GTP-binding motif-containing protein  29.08 
 
 		 324 aa  87.8  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1372  WD repeat-containing protein  28.48 
 
 		 324 aa  82.4  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.823736  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3798  hypothetical protein  28.98 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.599459  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0948  WD repeat-containing protein  27.91 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0862  WD-40 repeat-containing protein  30.42 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1390  WD-40 repeat protein  28.47 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0550315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2291  WD-40 repeat protein  28.83 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2841  hypothetical protein  28.05 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4555  WD-40 repeat-containing protein  29.27 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.999711  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4832  WD-40 repeat-containing protein  32.04 
 
 		 344 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3020  WD-40 repeat protein  28.98 
 
 		 332 aa  72.8  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0918  WD-40 repeat-containing protein  27.54 
 
 		 337 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3385  hypothetical protein  27.47 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3683  WD-40 repeat protein  28.28 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925722  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3424  hypothetical protein  28.21 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0709328  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1305  WD-40 repeat-containing protein  26.3 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.461181  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2615  WD-40 repeat protein  26.83 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.023853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2336  WD-40 repeat-containing protein  26.83 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173512  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2768  WD-40 repeat-containing protein  28.97 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2131  WD-40 repeat-containing protein  24.91 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0930  WD-40 repeat protein  29.17 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0847  WD-40 repeat-containing protein  27.08 
 
 		 339 aa  66.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.135434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1343  hypothetical protein  26.45 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808719  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3116  WD-40 repeat-containing protein  25.85 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0091  WD-40 repeat-containing protein  29.5 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0610  WD-40 repeat protein  25.14 
 
 		 349 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.520879  normal  0.0413859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0199  WD-40 repeat-containing protein  24.29 
 
 		 340 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0246963  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  39.06 
 
 		 1196 aa  42.7  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>