204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0930 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0930  WD-40 repeat protein  100 
 
 		 339 aa  683    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4555  WD-40 repeat-containing protein  81.71 
 
 		 339 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.999711  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0847  WD-40 repeat-containing protein  80.53 
 
 		 339 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.135434 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4832  WD-40 repeat-containing protein  72.27 
 
 		 344 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1343  hypothetical protein  72.57 
 
 		 339 aa  511  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808719  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3424  hypothetical protein  65.78 
 
 		 338 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0709328  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0918  WD-40 repeat-containing protein  64.94 
 
 		 337 aa  462  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2131  WD-40 repeat-containing protein  55.52 
 
 		 343 aa  352  5e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1390  WD-40 repeat protein  51.52 
 
 		 337 aa  311  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0550315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2291  WD-40 repeat protein  50.45 
 
 		 335 aa  309  4e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2615  WD-40 repeat protein  49.55 
 
 		 335 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.023853 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0862  WD-40 repeat-containing protein  52.44 
 
 		 337 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2336  WD-40 repeat-containing protein  49.24 
 
 		 335 aa  300  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173512  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0091  WD-40 repeat-containing protein  50.16 
 
 		 337 aa  295  6e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3116  WD-40 repeat-containing protein  51.61 
 
 		 335 aa  295  1e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3020  WD-40 repeat protein  48.44 
 
 		 332 aa  287  2e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2841  hypothetical protein  45.03 
 
 		 324 aa  275  6e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3798  hypothetical protein  48.63 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.599459  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0930  ATP/GTP-binding motif-containing protein  46.13 
 
 		 324 aa  270  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0988  WD repeat-containing protein  45.82 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3683  WD-40 repeat protein  46.95 
 
 		 329 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925722  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3385  hypothetical protein  46.65 
 
 		 329 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2768  WD-40 repeat-containing protein  45.73 
 
 		 329 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1372  WD repeat-containing protein  43.65 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.823736  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0610  WD-40 repeat protein  42.16 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.520879  normal  0.0413859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0199  WD-40 repeat-containing protein  40.22 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0246963  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1305  WD-40 repeat-containing protein  38.63 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.461181  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0948  WD repeat-containing protein  38.01 
 
 		 340 aa  165  9e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1045  WD-40 repeat-containing protein  30.77 
 
 		 357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1038  WD-40 repeat-containing protein  31.65 
 
 		 357 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  30.4 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19081  WD-40 repeat-containing G-protein  31.93 
 
 		 358 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.352529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  29.67 
 
 		 357 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11171  WD-40 repeat-containing G-protein  27.8 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.194374 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11281  WD-40 repeat-containing G-protein  29.23 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1713  WD-40 repeat-containing protein  26.86 
 
 		 367 aa  98.6  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15191  WD-40 repeat-containing G-protein  28.93 
 
 		 345 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3190  WD-40 repeat protein  26.91 
 
 		 358 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  24.39 
 
 		 947 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  29.1 
 
 		 1807 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5186  WD40 domain-containing protein  25.46 
 
 		 346 aa  79.3  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0863  WD-40 repeat protein  24.84 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.92 
 
 		 1481 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1908  WD-40 repeat protein  25 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0889  WD-40 repeat protein  24.52 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  26.92 
 
 		 1190 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  26.77 
 
 		 1789 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24.04 
 
 		 1363 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  27.55 
 
 		 1510 aa  73.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  27 
 
 		 1163 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0286  WD-40 repeat-containing protein  25.67 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.639022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  25.55 
 
 		 1236 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  25.42 
 
 		 1831 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  26.79 
 
 		 696 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  26.64 
 
 		 1229 aa  66.2  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  26.97 
 
 		 1477 aa  66.2  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  27.55 
 
 		 1553 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.42 
 
 		 1262 aa  64.3  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  24.91 
 
 		 1304 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  27.14 
 
 		 1348 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  27.66 
 
 		 790 aa  63.2  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.5 
 
 		 676 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  25.46 
 
 		 1552 aa  63.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  27.72 
 
 		 742 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  27.05 
 
 		 1177 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  26.85 
 
 		 344 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  27.12 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  27.27 
 
 		 1656 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  26.01 
 
 		 1766 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1384  hypothetical protein  28.67 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  26.57 
 
 		 1364 aa  61.2  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  24.36 
 
 		 1176 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  25.77 
 
 		 1661 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.46 
 
 		 740 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.2 
 
 		 898 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30 
 
 		 737 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  22.18 
 
 		 1652 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  26.64 
 
 		 1599 aa  60.1  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.18 
 
 		 1686 aa  59.3  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  24.29 
 
 		 1193 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  26.22 
 
 		 1196 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.18 
 
 		 1760 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  29.9 
 
 		 1858 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  22.82 
 
 		 1474 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.06 
 
 		 1599 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  24.24 
 
 		 1041 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.07 
 
 		 642 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  25.1 
 
 		 1209 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.71 
 
 		 1267 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.25 
 
 		 1684 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.27 
 
 		 924 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  30.17 
 
 		 1217 aa  57  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.75 
 
 		 919 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.57 
 
 		 1609 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  24.6 
 
 		 1367 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3070  WD-40 repeat protein  29.56 
 
 		 438 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  24.46 
 
 		 437 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  22.78 
 
 		 1714 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.62 
 
 		 1039 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.85 
 
 		 865 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>