202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2131 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2131  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 343 aa  679    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0918  WD-40 repeat-containing protein  55.18 
 
 		 337 aa  353  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0930  WD-40 repeat protein  55.52 
 
 		 339 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4555  WD-40 repeat-containing protein  55.35 
 
 		 339 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.999711  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1343  hypothetical protein  55.38 
 
 		 339 aa  348  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808719  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3424  hypothetical protein  53.99 
 
 		 338 aa  343  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0709328  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4832  WD-40 repeat-containing protein  55.18 
 
 		 344 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0847  WD-40 repeat-containing protein  53.37 
 
 		 339 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.135434 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3116  WD-40 repeat-containing protein  51.34 
 
 		 335 aa  334  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3020  WD-40 repeat protein  48.18 
 
 		 332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2841  hypothetical protein  49.06 
 
 		 324 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2291  WD-40 repeat protein  51.34 
 
 		 335 aa  305  7e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2615  WD-40 repeat protein  50.75 
 
 		 335 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.023853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2336  WD-40 repeat-containing protein  50.75 
 
 		 335 aa  301  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173512  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1390  WD-40 repeat protein  49.56 
 
 		 337 aa  295  9e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0550315  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0862  WD-40 repeat-containing protein  50.31 
 
 		 337 aa  291  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0091  WD-40 repeat-containing protein  49.24 
 
 		 337 aa  285  9e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2768  WD-40 repeat-containing protein  46.93 
 
 		 329 aa  282  6.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1372  WD repeat-containing protein  44.06 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.823736  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0988  WD repeat-containing protein  45.31 
 
 		 324 aa  276  4e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0930  ATP/GTP-binding motif-containing protein  45.6 
 
 		 324 aa  275  7e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3683  WD-40 repeat protein  45.85 
 
 		 329 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925722  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3385  hypothetical protein  45.54 
 
 		 329 aa  272  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3798  hypothetical protein  47.06 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.599459  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1305  WD-40 repeat-containing protein  41.19 
 
 		 348 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.461181  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0610  WD-40 repeat protein  42.25 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.520879  normal  0.0413859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0199  WD-40 repeat-containing protein  41.7 
 
 		 340 aa  202  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0246963  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0948  WD repeat-containing protein  43.17 
 
 		 340 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19081  WD-40 repeat-containing G-protein  32.36 
 
 		 358 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.352529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1038  WD-40 repeat-containing protein  32.49 
 
 		 357 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1045  WD-40 repeat-containing protein  31.18 
 
 		 357 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11171  WD-40 repeat-containing G-protein  30.38 
 
 		 357 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.194374 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  30.82 
 
 		 357 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  30.47 
 
 		 357 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1713  WD-40 repeat-containing protein  29.27 
 
 		 367 aa  95.9  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11281  WD-40 repeat-containing G-protein  29.89 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15191  WD-40 repeat-containing G-protein  29.71 
 
 		 345 aa  89.4  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0863  WD-40 repeat protein  23.86 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0889  WD-40 repeat protein  23.86 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.18 
 
 		 740 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5186  WD40 domain-containing protein  24.5 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3190  WD-40 repeat protein  24.46 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  27.23 
 
 		 1789 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  26.94 
 
 		 1163 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  25.55 
 
 		 1510 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.38 
 
 		 1481 aa  67  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  34.2 
 
 		 872 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  30.9 
 
 		 1858 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1384  hypothetical protein  25.71 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  25.86 
 
 		 1304 aa  63.5  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.25 
 
 		 676 aa  63.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.56 
 
 		 1240 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  25.1 
 
 		 1553 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1908  WD-40 repeat protein  26.87 
 
 		 365 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.88 
 
 		 1609 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  24.66 
 
 		 947 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.97 
 
 		 1599 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.98 
 
 		 1598 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  27.96 
 
 		 1229 aa  60.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.05 
 
 		 677 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6487  WD-40 repeat-containing protein  32.63 
 
 		 780 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.09 
 
 		 1363 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0286  WD-40 repeat-containing protein  24.6 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.639022 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  22.74 
 
 		 1161 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  27.92 
 
 		 1264 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  27.92 
 
 		 1264 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.88 
 
 		 1364 aa  59.7  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.85 
 
 		 1652 aa  59.7  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.29 
 
 		 1583 aa  59.3  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  30.91 
 
 		 1209 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.65 
 
 		 1607 aa  59.3  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  22.81 
 
 		 1161 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  29.91 
 
 		 1100 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.7 
 
 		 1686 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.58 
 
 		 1684 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.88 
 
 		 833 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  25.17 
 
 		 1236 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.5 
 
 		 1267 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  26.5 
 
 		 1807 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  23.53 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  28.87 
 
 		 790 aa  57.4  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  29.86 
 
 		 1901 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.03 
 
 		 1760 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  32.26 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  26.84 
 
 		 1766 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.43 
 
 		 1623 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  30.32 
 
 		 1214 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  30.23 
 
 		 1344 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.8 
 
 		 1547 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  29.63 
 
 		 1661 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0987  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.91 
 
 		 842 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.466827  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.33 
 
 		 642 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  24.01 
 
 		 1831 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  27.78 
 
 		 1523 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  26.74 
 
 		 1348 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  23.57 
 
 		 565 aa  54.3  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  32.38 
 
 		 919 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  31.73 
 
 		 1217 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  28.06 
 
 		 1242 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.26 
 
 		 865 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>