271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1713 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1713  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 367 aa  741    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1038  WD-40 repeat-containing protein  29.32 
 
 		 357 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11171  WD-40 repeat-containing G-protein  29.16 
 
 		 357 aa  139  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.194374 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11281  WD-40 repeat-containing G-protein  29.09 
 
 		 357 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19081  WD-40 repeat-containing G-protein  28.96 
 
 		 358 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.352529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15191  WD-40 repeat-containing G-protein  29.75 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  29.27 
 
 		 357 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1045  WD-40 repeat-containing protein  29 
 
 		 357 aa  133  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  29.27 
 
 		 357 aa  133  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  26.99 
 
 		 1831 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0286  WD-40 repeat-containing protein  27.63 
 
 		 386 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.639022 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5186  WD40 domain-containing protein  27.08 
 
 		 346 aa  102  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1305  WD-40 repeat-containing protein  28.47 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.461181  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0930  WD-40 repeat protein  27.21 
 
 		 339 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.13 
 
 		 1652 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4832  WD-40 repeat-containing protein  32.09 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0847  WD-40 repeat-containing protein  26.39 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.135434 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1908  WD-40 repeat protein  26.79 
 
 		 365 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0863  WD-40 repeat protein  25.61 
 
 		 358 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2131  WD-40 repeat-containing protein  29.27 
 
 		 343 aa  96.3  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  24.64 
 
 		 1236 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0889  WD-40 repeat protein  25.34 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.97 
 
 		 1481 aa  94.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1343  hypothetical protein  26.85 
 
 		 339 aa  94.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808719  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0918  WD-40 repeat-containing protein  25.77 
 
 		 337 aa  94  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4555  WD-40 repeat-containing protein  25.68 
 
 		 339 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.999711  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  24.06 
 
 		 1789 aa  93.6  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  29.56 
 
 		 696 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0862  WD-40 repeat-containing protein  31.73 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0199  WD-40 repeat-containing protein  30.27 
 
 		 340 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0246963  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3424  hypothetical protein  25.6 
 
 		 338 aa  89.4  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0709328  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  23.77 
 
 		 1553 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 1221 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0988  WD repeat-containing protein  26.89 
 
 		 324 aa  87  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0948  WD repeat-containing protein  31.63 
 
 		 340 aa  86.3  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0091  WD-40 repeat-containing protein  32.11 
 
 		 337 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0930  ATP/GTP-binding motif-containing protein  26.89 
 
 		 324 aa  86.7  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2615  WD-40 repeat protein  33.63 
 
 		 335 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.023853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2336  WD-40 repeat-containing protein  35.15 
 
 		 335 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173512  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  27.27 
 
 		 1901 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  24.59 
 
 		 1766 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  25.66 
 
 		 1161 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  25.66 
 
 		 1161 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  28.57 
 
 		 1217 aa  85.1  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3190  WD-40 repeat protein  25 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  22.2 
 
 		 947 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1390  WD-40 repeat protein  27.59 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0550315  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  25.27 
 
 		 1163 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.01 
 
 		 1711 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.12 
 
 		 1686 aa  83.2  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  24.32 
 
 		 1510 aa  83.2  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2291  WD-40 repeat protein  33.63 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  0.504571 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  25.15 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3020  WD-40 repeat protein  28.57 
 
 		 332 aa  82  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  23.08 
 
 		 1363 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0610  WD-40 repeat protein  25.41 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.520879  normal  0.0413859 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.3 
 
 		 919 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.57 
 
 		 1599 aa  81.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.38 
 
 		 1262 aa  81.3  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  26.93 
 
 		 1656 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.27 
 
 		 1557 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.74 
 
 		 1823 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  25.14 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  28.66 
 
 		 1357 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.67 
 
 		 1004 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  24.25 
 
 		 1364 aa  77.8  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3798  hypothetical protein  31.84 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.599459  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3116  WD-40 repeat-containing protein  27.03 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2841  hypothetical protein  25.21 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  24.66 
 
 		 565 aa  75.9  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  23.63 
 
 		 1188 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  23.48 
 
 		 1229 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0547  WD-40 repeat protein  25.82 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1372  WD repeat-containing protein  25.52 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.823736  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  23.84 
 
 		 1661 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  24.06 
 
 		 1188 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  25.46 
 
 		 1454 aa  74.3  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3683  WD-40 repeat protein  27.27 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925722  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 		 1599 aa  73.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  26.61 
 
 		 608 aa  73.6  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 		 1399 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2768  WD-40 repeat-containing protein  27.55 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  26.69 
 
 		 742 aa  72.4  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  24.78 
 
 		 1552 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  25.46 
 
 		 1330 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  23.84 
 
 		 1196 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  24.2 
 
 		 1807 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  21.72 
 
 		 1443 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  24.01 
 
 		 1213 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 		 1714 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.92 
 
 		 642 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3385  hypothetical protein  27.45 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  24.78 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  23.68 
 
 		 1523 aa  70.1  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.66 
 
 		 740 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  22.95 
 
 		 1193 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  26.82 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  21.92 
 
 		 1190 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32006  WD domain protein  21.47 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.31 
 
 		 924 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>