282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1045 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  98.6 
 
 		 357 aa  724    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1045  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 357 aa  733    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  98.6 
 
 		 357 aa  726    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11281  WD-40 repeat-containing G-protein  82.35 
 
 		 357 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1038  WD-40 repeat-containing protein  69.66 
 
 		 357 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19081  WD-40 repeat-containing G-protein  69.19 
 
 		 358 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.352529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15191  WD-40 repeat-containing G-protein  66.09 
 
 		 345 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11171  WD-40 repeat-containing G-protein  60.11 
 
 		 357 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.194374 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1305  WD-40 repeat-containing protein  31.86 
 
 		 348 aa  135  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.461181  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0610  WD-40 repeat protein  29.83 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.520879  normal  0.0413859 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1713  WD-40 repeat-containing protein  29 
 
 		 367 aa  132  9e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1390  WD-40 repeat protein  32.72 
 
 		 337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0550315  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0930  WD-40 repeat protein  30.77 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2615  WD-40 repeat protein  31.27 
 
 		 335 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.023853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2336  WD-40 repeat-containing protein  30.71 
 
 		 335 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173512  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0918  WD-40 repeat-containing protein  30.29 
 
 		 337 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0847  WD-40 repeat-containing protein  30.03 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.135434 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3116  WD-40 repeat-containing protein  29.85 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2841  hypothetical protein  30.98 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4555  WD-40 repeat-containing protein  27.27 
 
 		 339 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.999711  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2291  WD-40 repeat protein  29.71 
 
 		 335 aa  105  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3020  WD-40 repeat protein  29.55 
 
 		 332 aa  103  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0862  WD-40 repeat-containing protein  28.34 
 
 		 337 aa  103  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0199  WD-40 repeat-containing protein  29.92 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0246963  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3424  hypothetical protein  27.9 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0709328  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2131  WD-40 repeat-containing protein  31.18 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2768  WD-40 repeat-containing protein  30 
 
 		 329 aa  97.8  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4832  WD-40 repeat-containing protein  29.46 
 
 		 344 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5186  WD40 domain-containing protein  26.39 
 
 		 346 aa  97.1  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  28.29 
 
 		 1357 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0988  WD repeat-containing protein  29.01 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0091  WD-40 repeat-containing protein  30.45 
 
 		 337 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0930  ATP/GTP-binding motif-containing protein  29.01 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1372  WD repeat-containing protein  28.63 
 
 		 324 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.823736  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0948  WD repeat-containing protein  29 
 
 		 340 aa  93.6  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.75 
 
 		 1686 aa  93.2  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1343  hypothetical protein  27.24 
 
 		 339 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808719  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  25.14 
 
 		 1164 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  23.05 
 
 		 696 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.97 
 
 		 1364 aa  88.2  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0286  WD-40 repeat-containing protein  24.51 
 
 		 386 aa  86.7  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.639022 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  27.08 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3385  hypothetical protein  28.79 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  24.52 
 
 		 1553 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1908  WD-40 repeat protein  24.76 
 
 		 365 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3683  WD-40 repeat protein  28.79 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925722  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 		 1510 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.62 
 
 		 642 aa  83.6  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  26.46 
 
 		 1714 aa  83.6  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.93 
 
 		 1652 aa  82.8  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.92 
 
 		 1481 aa  82.8  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0863  WD-40 repeat protein  23.55 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  25.54 
 
 		 1831 aa  81.3  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  28.67 
 
 		 1163 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  24.78 
 
 		 947 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1858 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  23.75 
 
 		 1789 aa  80.9  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  28.62 
 
 		 1236 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  24.11 
 
 		 1523 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  25.17 
 
 		 1363 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.94 
 
 		 919 aa  79.7  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0889  WD-40 repeat protein  23.23 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3798  hypothetical protein  28.69 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.599459  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3190  WD-40 repeat protein  24.28 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.6 
 
 		 1760 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  25.45 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  25.75 
 
 		 1661 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  25.32 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.65 
 
 		 675 aa  76.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  26.22 
 
 		 1100 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.78 
 
 		 1609 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  23.21 
 
 		 1193 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.87 
 
 		 740 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  25.86 
 
 		 1807 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  25.08 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.25 
 
 		 630 aa  73.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  24.83 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  25.08 
 
 		 1161 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  25.95 
 
 		 774 aa  73.9  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  23.47 
 
 		 742 aa  73.2  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.49 
 
 		 1557 aa  72.8  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  24.91 
 
 		 1213 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  24.59 
 
 		 1161 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  26.3 
 
 		 342 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  26.12 
 
 		 1552 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  27.06 
 
 		 1373 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  24.51 
 
 		 443 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  27.69 
 
 		 1599 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.56 
 
 		 1711 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.17 
 
 		 924 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  23.56 
 
 		 1454 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  22.34 
 
 		 1247 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.93 
 
 		 698 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  24.84 
 
 		 1411 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  27.39 
 
 		 1190 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 1221 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  26.06 
 
 		 1656 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  24.75 
 
 		 1766 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  27.95 
 
 		 1217 aa  70.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  24.76 
 
 		 1901 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>