220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0199 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0199  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 340 aa  670    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0246963  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0610  WD-40 repeat protein  38.94 
 
 		 349 aa  216  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.520879  normal  0.0413859 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0988  WD repeat-containing protein  41.46 
 
 		 324 aa  215  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0930  ATP/GTP-binding motif-containing protein  41.46 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1372  WD repeat-containing protein  40.71 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.823736  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2841  hypothetical protein  41.27 
 
 		 324 aa  212  7e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1305  WD-40 repeat-containing protein  42.81 
 
 		 348 aa  210  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.461181  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2131  WD-40 repeat-containing protein  42.16 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3424  hypothetical protein  39.94 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0709328  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0918  WD-40 repeat-containing protein  40.56 
 
 		 337 aa  207  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3020  WD-40 repeat protein  41.64 
 
 		 332 aa  206  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2768  WD-40 repeat-containing protein  41 
 
 		 329 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1390  WD-40 repeat protein  42.01 
 
 		 337 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0550315  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0930  WD-40 repeat protein  39.93 
 
 		 339 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2291  WD-40 repeat protein  41.74 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0862  WD-40 repeat-containing protein  43.4 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3116  WD-40 repeat-containing protein  36.76 
 
 		 335 aa  196  5.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4555  WD-40 repeat-containing protein  39.68 
 
 		 339 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.999711  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2336  WD-40 repeat-containing protein  41.14 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173512  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0847  WD-40 repeat-containing protein  40.07 
 
 		 339 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.135434 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2615  WD-40 repeat protein  41.14 
 
 		 335 aa  192  7e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.023853 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3683  WD-40 repeat protein  40.4 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925722  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3385  hypothetical protein  41.06 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4832  WD-40 repeat-containing protein  39.38 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1343  hypothetical protein  38.29 
 
 		 339 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808719  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3798  hypothetical protein  40.47 
 
 		 328 aa  185  9e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.599459  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0091  WD-40 repeat-containing protein  38.92 
 
 		 337 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0948  WD repeat-containing protein  39.2 
 
 		 340 aa  152  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1038  WD-40 repeat-containing protein  33.2 
 
 		 357 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19081  WD-40 repeat-containing G-protein  33.2 
 
 		 358 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.352529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15191  WD-40 repeat-containing G-protein  30.72 
 
 		 345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11281  WD-40 repeat-containing G-protein  31.1 
 
 		 357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1045  WD-40 repeat-containing protein  30.26 
 
 		 357 aa  115  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  30.29 
 
 		 357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  29.61 
 
 		 357 aa  112  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11171  WD-40 repeat-containing G-protein  31.53 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.194374 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5186  WD40 domain-containing protein  27.65 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1713  WD-40 repeat-containing protein  30.27 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0889  WD-40 repeat protein  28.34 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0863  WD-40 repeat protein  28.34 
 
 		 358 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0286  WD-40 repeat-containing protein  30.52 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.639022 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1908  WD-40 repeat protein  27.05 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  29.55 
 
 		 1217 aa  76.3  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  27.62 
 
 		 1807 aa  73.9  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  25.39 
 
 		 1304 aa  73.2  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  23.77 
 
 		 1229 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.09 
 
 		 1481 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.35 
 
 		 943 aa  71.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  25.96 
 
 		 1858 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.87 
 
 		 740 aa  70.1  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  27.09 
 
 		 1214 aa  69.7  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  24.14 
 
 		 1477 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.39 
 
 		 1684 aa  67  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  30.36 
 
 		 1523 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  26.41 
 
 		 1553 aa  66.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.27 
 
 		 677 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  24.88 
 
 		 1161 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  24.88 
 
 		 1161 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.74 
 
 		 1599 aa  65.9  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  23.55 
 
 		 1510 aa  65.9  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.22 
 
 		 682 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.24 
 
 		 676 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3190  WD-40 repeat protein  20.82 
 
 		 358 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.06 
 
 		 865 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25.14 
 
 		 696 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 1221 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.41 
 
 		 833 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.16 
 
 		 1598 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  26.18 
 
 		 1364 aa  63.9  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  26.17 
 
 		 1247 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.19 
 
 		 1626 aa  63.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.15 
 
 		 1686 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  24.76 
 
 		 1190 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  28.45 
 
 		 1656 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.71 
 
 		 1267 aa  62.8  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24.17 
 
 		 1363 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  26.58 
 
 		 1183 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.59 
 
 		 630 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  24.68 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  26.42 
 
 		 1789 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.71 
 
 		 737 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  26.75 
 
 		 1334 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.6 
 
 		 1652 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  24.7 
 
 		 1831 aa  60.1  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  23.94 
 
 		 687 aa  59.7  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  24.16 
 
 		 1163 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.73 
 
 		 1583 aa  59.3  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  26.91 
 
 		 1901 aa  59.7  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  23.05 
 
 		 1164 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.91 
 
 		 622 aa  59.3  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  27.08 
 
 		 1211 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6487  WD-40 repeat-containing protein  29.7 
 
 		 780 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  27.44 
 
 		 1401 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  25.54 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.6 
 
 		 924 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.46 
 
 		 1823 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.63 
 
 		 919 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  28.99 
 
 		 1491 aa  58.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  27.41 
 
 		 872 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.35 
 
 		 898 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>