146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3683 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3683  WD-40 repeat protein  100 
 
 		 329 aa  667    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925722  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3385  hypothetical protein  95.74 
 
 		 329 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2768  WD-40 repeat-containing protein  77.13 
 
 		 329 aa  531  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3798  hypothetical protein  74.09 
 
 		 328 aa  509  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.599459  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2841  hypothetical protein  63.83 
 
 		 324 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1372  WD repeat-containing protein  63.11 
 
 		 324 aa  438  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.823736  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0988  WD repeat-containing protein  63.11 
 
 		 324 aa  434  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0930  ATP/GTP-binding motif-containing protein  63.11 
 
 		 324 aa  433  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3020  WD-40 repeat protein  47.72 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4555  WD-40 repeat-containing protein  48.9 
 
 		 339 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.999711  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2131  WD-40 repeat-containing protein  45.85 
 
 		 343 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0918  WD-40 repeat-containing protein  44.82 
 
 		 337 aa  269  4e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3424  hypothetical protein  45.12 
 
 		 338 aa  268  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0709328  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2291  WD-40 repeat protein  47.43 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1343  hypothetical protein  45.9 
 
 		 339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808719  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4832  WD-40 repeat-containing protein  45.43 
 
 		 344 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0930  WD-40 repeat protein  46.95 
 
 		 339 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2615  WD-40 repeat protein  46.83 
 
 		 335 aa  263  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.023853 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3116  WD-40 repeat-containing protein  44.3 
 
 		 335 aa  262  6e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2336  WD-40 repeat-containing protein  46.83 
 
 		 335 aa  261  8e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173512  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0847  WD-40 repeat-containing protein  45.94 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.135434 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0091  WD-40 repeat-containing protein  45.73 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1390  WD-40 repeat protein  46.47 
 
 		 337 aa  255  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0550315  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0862  WD-40 repeat-containing protein  47.4 
 
 		 337 aa  250  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0610  WD-40 repeat protein  40.74 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.520879  normal  0.0413859 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1305  WD-40 repeat-containing protein  41.39 
 
 		 348 aa  207  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.461181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0199  WD-40 repeat-containing protein  40.43 
 
 		 340 aa  185  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0246963  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0948  WD repeat-containing protein  35.19 
 
 		 340 aa  159  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11281  WD-40 repeat-containing G-protein  27.65 
 
 		 357 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19081  WD-40 repeat-containing G-protein  27.02 
 
 		 358 aa  85.1  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.352529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1038  WD-40 repeat-containing protein  27.42 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1045  WD-40 repeat-containing protein  28.79 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15191  WD-40 repeat-containing G-protein  28.28 
 
 		 345 aa  82.8  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  28.68 
 
 		 357 aa  82.8  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  28.79 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11171  WD-40 repeat-containing G-protein  28.34 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.194374 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1713  WD-40 repeat-containing protein  30.36 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  27.56 
 
 		 1190 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3190  WD-40 repeat protein  27.08 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  27.97 
 
 		 1217 aa  67  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1384  hypothetical protein  27.36 
 
 		 376 aa  66.6  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  27.5 
 
 		 1163 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  26.15 
 
 		 1348 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.57 
 
 		 1363 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25.21 
 
 		 696 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1908  WD-40 repeat protein  26.3 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0889  WD-40 repeat protein  25.34 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0863  WD-40 repeat protein  25.95 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5186  WD40 domain-containing protein  23.93 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  26.55 
 
 		 1766 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  25.7 
 
 		 1209 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.17 
 
 		 576 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1858 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  28.8 
 
 		 1357 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  24.8 
 
 		 1789 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  25 
 
 		 947 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  25.19 
 
 		 1477 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0286  WD-40 repeat-containing protein  23.74 
 
 		 386 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.639022 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  29.05 
 
 		 1161 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  29.05 
 
 		 1161 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.99 
 
 		 1711 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.78 
 
 		 1481 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  24.32 
 
 		 1552 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2789  hypothetical protein  24.63 
 
 		 361 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.70665  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  26.47 
 
 		 1652 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  30.67 
 
 		 1214 aa  53.1  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.41 
 
 		 1557 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.67 
 
 		 1686 aa  52.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.04 
 
 		 833 aa  52.8  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  23.44 
 
 		 1661 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.14 
 
 		 675 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  24.14 
 
 		 1041 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.93 
 
 		 1623 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  27.41 
 
 		 790 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1263  WD-40 repeat protein  26 
 
 		 377 aa  51.2  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  23.2 
 
 		 1229 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.58 
 
 		 1240 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.44 
 
 		 1760 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.14 
 
 		 1039 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.48 
 
 		 1262 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  21.54 
 
 		 1411 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  29.1 
 
 		 1196 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  29.49 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1511  hypothetical protein  23.64 
 
 		 361 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.338028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  26.18 
 
 		 1236 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  23.91 
 
 		 1364 aa  50.1  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  24.62 
 
 		 316 aa  49.7  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  26.13 
 
 		 1176 aa  49.3  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1807 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.97 
 
 		 1072 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  27.85 
 
 		 1491 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  24.46 
 
 		 1657 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25 
 
 		 1609 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  23.28 
 
 		 1656 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.21 
 
 		 1267 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.97 
 
 		 1072 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.75 
 
 		 1607 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.58 
 
 		 1004 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  25.81 
 
 		 1211 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  25.29 
 
 		 437 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>