120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3116 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3116  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 335 aa  692    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3020  WD-40 repeat protein  62.09 
 
 		 332 aa  437  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2291  WD-40 repeat protein  59.94 
 
 		 335 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1390  WD-40 repeat protein  58.33 
 
 		 337 aa  391  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0550315  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2336  WD-40 repeat-containing protein  59.05 
 
 		 335 aa  388  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173512  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2615  WD-40 repeat protein  59.05 
 
 		 335 aa  388  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.023853 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0091  WD-40 repeat-containing protein  57.58 
 
 		 337 aa  378  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0862  WD-40 repeat-containing protein  57.44 
 
 		 337 aa  368  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2131  WD-40 repeat-containing protein  51.34 
 
 		 343 aa  334  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4832  WD-40 repeat-containing protein  51.2 
 
 		 344 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0918  WD-40 repeat-containing protein  48.16 
 
 		 337 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4555  WD-40 repeat-containing protein  47.9 
 
 		 339 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.999711  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3424  hypothetical protein  45.45 
 
 		 338 aa  297  1e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0709328  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0930  WD-40 repeat protein  51.61 
 
 		 339 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0847  WD-40 repeat-containing protein  46.11 
 
 		 339 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.135434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1343  hypothetical protein  47.01 
 
 		 339 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808719  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3798  hypothetical protein  46.08 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.599459  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2841  hypothetical protein  45.34 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0988  WD repeat-containing protein  46.15 
 
 		 324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0930  ATP/GTP-binding motif-containing protein  46.15 
 
 		 324 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1372  WD repeat-containing protein  43.73 
 
 		 324 aa  269  5e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.823736  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2768  WD-40 repeat-containing protein  45.74 
 
 		 329 aa  268  8e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3683  WD-40 repeat protein  44.3 
 
 		 329 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925722  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3385  hypothetical protein  43.99 
 
 		 329 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0610  WD-40 repeat protein  42.57 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.520879  normal  0.0413859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0948  WD repeat-containing protein  41.4 
 
 		 340 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1305  WD-40 repeat-containing protein  40.58 
 
 		 348 aa  208  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.461181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0199  WD-40 repeat-containing protein  36.81 
 
 		 340 aa  190  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0246963  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15191  WD-40 repeat-containing G-protein  31.6 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11171  WD-40 repeat-containing G-protein  31.58 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.194374 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1045  WD-40 repeat-containing protein  29.85 
 
 		 357 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19081  WD-40 repeat-containing G-protein  32.22 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.352529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  30.77 
 
 		 357 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1038  WD-40 repeat-containing protein  31.51 
 
 		 357 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11281  WD-40 repeat-containing G-protein  31.71 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  29.48 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5186  WD40 domain-containing protein  25.32 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3190  WD-40 repeat protein  25.16 
 
 		 358 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1713  WD-40 repeat-containing protein  27.03 
 
 		 367 aa  76.6  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0863  WD-40 repeat protein  25.16 
 
 		 358 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0889  WD-40 repeat protein  25 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1511  hypothetical protein  27.74 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.338028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0286  WD-40 repeat-containing protein  24.5 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.639022 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2789  hypothetical protein  27.21 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.70665  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1908  WD-40 repeat protein  25.89 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1384  hypothetical protein  26.11 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  25.1 
 
 		 1401 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3255  WD-40 repeat-containing protein  27.91 
 
 		 366 aa  55.8  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0515461  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  24.54 
 
 		 342 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  23.74 
 
 		 1363 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  26.06 
 
 		 1190 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  35.14 
 
 		 1344 aa  53.5  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  20.86 
 
 		 1760 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3114  WD-40 repeat protein  24.84 
 
 		 816 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.122668  normal  0.0357376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  26.63 
 
 		 1552 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.61 
 
 		 943 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  24.66 
 
 		 1304 aa  49.7  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  26.92 
 
 		 405 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  21.84 
 
 		 1163 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  22.63 
 
 		 1364 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1339  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 		 504 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143259  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.84 
 
 		 1711 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  28.45 
 
 		 1100 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3742  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.58 
 
 		 806 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  24.32 
 
 		 1177 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  25.27 
 
 		 1188 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  24.2 
 
 		 437 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  24 
 
 		 1373 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  22.09 
 
 		 1164 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 		 464 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.22 
 
 		 622 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  23.73 
 
 		 1209 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  23.87 
 
 		 316 aa  46.2  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25.73 
 
 		 696 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0358  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.36 
 
 		 997 aa  46.2  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0296381 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  26.6 
 
 		 402 aa  46.2  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.68 
 
 		 757 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  22.86 
 
 		 1789 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6487  WD-40 repeat-containing protein  24.15 
 
 		 780 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0547  WD-40 repeat protein  27.76 
 
 		 477 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  22.28 
 
 		 1161 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.21 
 
 		 1856 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  22.28 
 
 		 1161 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  26.58 
 
 		 1196 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  25.97 
 
 		 1477 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.87 
 
 		 1076 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.8 
 
 		 740 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.06 
 
 		 737 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  24.71 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  20.49 
 
 		 1229 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  23.7 
 
 		 346 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.05 
 
 		 1557 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.15 
 
 		 675 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  22.16 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.7 
 
 		 1072 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  23.39 
 
 		 1831 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.39 
 
 		 930 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  22.38 
 
 		 1411 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.81 
 
 		 1686 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  24.22 
 
 		 1858 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>