More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_29608 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  100 
 
 		 402 aa  837    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_2326  predicted protein  45.05 
 
 		 363 aa  317  2e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01430  conserved hypothetical protein  40.77 
 
 		 712 aa  292  5e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51666  polyadenylation factor I subunit 2  37.77 
 
 		 541 aa  265  1e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06160  Polyadenylation factor subunit 2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AZX0]  37.61 
 
 		 567 aa  258  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  31.56 
 
 		 1831 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  32.62 
 
 		 1443 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  27.24 
 
 		 1652 aa  143  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 1221 aa  142  8e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  31.34 
 
 		 1363 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  30.82 
 
 		 1236 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.87 
 
 		 1364 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  29.12 
 
 		 1474 aa  133  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  29.68 
 
 		 1163 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.17 
 
 		 677 aa  129  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  30.26 
 
 		 1196 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.86 
 
 		 1557 aa  127  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  27.11 
 
 		 1901 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.11 
 
 		 576 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  27.66 
 
 		 1213 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  32.1 
 
 		 696 aa  123  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  28.27 
 
 		 1523 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.02 
 
 		 740 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  27.96 
 
 		 1789 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  26.57 
 
 		 1807 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.92 
 
 		 676 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  28.37 
 
 		 947 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.14 
 
 		 692 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.42 
 
 		 642 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.52 
 
 		 1240 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.07 
 
 		 1262 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  27.57 
 
 		 443 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  27.3 
 
 		 1193 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.75 
 
 		 1760 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.19 
 
 		 924 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  26.95 
 
 		 1416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  27.39 
 
 		 742 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  25.94 
 
 		 1454 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  27.21 
 
 		 1217 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  26.1 
 
 		 1188 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  25.68 
 
 		 505 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.11 
 
 		 682 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  24.44 
 
 		 589 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  30.43 
 
 		 790 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.82 
 
 		 919 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  27.56 
 
 		 344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  28.36 
 
 		 1868 aa  110  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  28.62 
 
 		 434 aa  109  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.27 
 
 		 1267 aa  109  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  25.18 
 
 		 1878 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.71 
 
 		 1686 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.34 
 
 		 1711 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.12 
 
 		 596 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  23.26 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.52 
 
 		 1481 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  25.77 
 
 		 565 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  28.16 
 
 		 1190 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.4 
 
 		 664 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  25.34 
 
 		 1553 aa  106  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.18 
 
 		 1398 aa  106  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  24.27 
 
 		 1858 aa  106  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  28.67 
 
 		 1599 aa  106  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  27.68 
 
 		 687 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  22.7 
 
 		 464 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  28.1 
 
 		 577 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  28.52 
 
 		 1247 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  26.67 
 
 		 344 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01208  Pre-mRNA-splicing factor prp46 (Pre-mRNA-processing protein 46) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BE22]  30.54 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.89 
 
 		 1547 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  27.04 
 
 		 782 aa  103  4e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  28.11 
 
 		 335 aa  103  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.16 
 
 		 1599 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00940  transcription initiation factor tfiid 90 kda subunit (tafii-90), putative  31.94 
 
 		 813 aa  102  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.152566  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  26.13 
 
 		 774 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  26.13 
 
 		 1211 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  27.53 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  29.72 
 
 		 1411 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  29.7 
 
 		 1209 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  24.8 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  27.53 
 
 		 1357 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11593  predicted protein  31.53 
 
 		 324 aa  100  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.23856  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  22.77 
 
 		 1188 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  23.67 
 
 		 1552 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  25.46 
 
 		 1714 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  29.28 
 
 		 1344 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0196  WD40 repeat, subgroup  26.89 
 
 		 840 aa  100  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  25.71 
 
 		 578 aa  99.8  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  27.73 
 
 		 574 aa  99  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  41.55 
 
 		 954 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  28.72 
 
 		 540 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  25.6 
 
 		 608 aa  97.8  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22 
 
 		 1607 aa  97.4  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.38 
 
 		 1623 aa  97.8  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  26.83 
 
 		 316 aa  97.4  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.76 
 
 		 1598 aa  97.1  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0243  WD-40 repeat-containing protein  25.85 
 
 		 335 aa  97.4  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  23 
 
 		 1164 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28 
 
 		 698 aa  96.7  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  32.93 
 
 		 316 aa  96.7  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  24.63 
 
 		 778 aa  96.3  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>