More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC01430 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC01430  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 712 aa  1448    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51666  polyadenylation factor I subunit 2  38.69 
 
 		 541 aa  328  2.0000000000000001e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  39.95 
 
 		 402 aa  289  1e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06160  Polyadenylation factor subunit 2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AZX0]  38.65 
 
 		 567 aa  283  1e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_2326  predicted protein  39.61 
 
 		 363 aa  278  2e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  31.07 
 
 		 1831 aa  137  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  31.9 
 
 		 1363 aa  134  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  31.52 
 
 		 1236 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  29.01 
 
 		 1163 aa  127  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  31.43 
 
 		 1652 aa  126  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  29.54 
 
 		 696 aa  125  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  28.98 
 
 		 1364 aa  120  7.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  26.29 
 
 		 742 aa  117  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.3 
 
 		 1262 aa  116  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.21 
 
 		 740 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  28.04 
 
 		 1878 aa  113  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  29.55 
 
 		 1454 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  31.56 
 
 		 947 aa  111  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.09 
 
 		 677 aa  111  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.84 
 
 		 1557 aa  110  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 1686 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  29.08 
 
 		 1714 aa  109  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.01 
 
 		 1623 aa  109  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 1221 aa  108  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  23.53 
 
 		 1807 aa  106  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  30.33 
 
 		 443 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  27.09 
 
 		 1196 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.57 
 
 		 676 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  29.55 
 
 		 1217 aa  105  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  28.16 
 
 		 1367 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  28.82 
 
 		 608 aa  104  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  26.83 
 
 		 1553 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.81 
 
 		 664 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  28.62 
 
 		 344 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  27.61 
 
 		 1193 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  26.88 
 
 		 1474 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  26.73 
 
 		 1901 aa  101  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  27.17 
 
 		 1523 aa  101  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.05 
 
 		 576 aa  101  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  25.27 
 
 		 316 aa  101  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  27.8 
 
 		 316 aa  101  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  32.09 
 
 		 1214 aa  101  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.48 
 
 		 682 aa  101  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  28.11 
 
 		 434 aa  100  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.23 
 
 		 1481 aa  99.8  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.91 
 
 		 1599 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  26.99 
 
 		 1443 aa  99.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  27.74 
 
 		 344 aa  98.6  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.21 
 
 		 1760 aa  99  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.62 
 
 		 1856 aa  98.6  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  28.83 
 
 		 687 aa  98.6  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  24.24 
 
 		 464 aa  97.4  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.36 
 
 		 642 aa  97.4  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  29.9 
 
 		 790 aa  97.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  30.49 
 
 		 540 aa  95.9  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.09 
 
 		 1583 aa  95.5  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  31.36 
 
 		 919 aa  95.5  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  28.67 
 
 		 1344 aa  94.7  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  23.03 
 
 		 782 aa  94.7  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  26.5 
 
 		 1100 aa  94.7  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4979  WD-40 repeat-containing protein  22.68 
 
 		 578 aa  94.7  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.48 
 
 		 698 aa  94.4  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  23.66 
 
 		 316 aa  94  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  27.87 
 
 		 872 aa  94.4  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  24.65 
 
 		 589 aa  94  9e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.79 
 
 		 924 aa  93.6  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.35 
 
 		 1609 aa  93.6  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.13 
 
 		 1267 aa  93.6  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  26.32 
 
 		 1510 aa  94  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  26.95 
 
 		 1161 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0059  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.3 
 
 		 692 aa  92.8  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.367028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  27.14 
 
 		 1552 aa  92.8  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  26.95 
 
 		 1161 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  29.27 
 
 		 1789 aa  92  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.86 
 
 		 1711 aa  92.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.37 
 
 		 596 aa  92.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  22.26 
 
 		 1213 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.06 
 
 		 1240 aa  92  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6487  WD-40 repeat-containing protein  26.03 
 
 		 780 aa  91.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  27.68 
 
 		 1357 aa  91.3  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24 
 
 		 1607 aa  91.3  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  23.49 
 
 		 317 aa  90.9  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0373  WD-40 repeat protein  24.01 
 
 		 316 aa  90.9  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000526871  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.9 
 
 		 1598 aa  90.9  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  28.9 
 
 		 1190 aa  90.5  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  30.77 
 
 		 1188 aa  90.5  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.02 
 
 		 1684 aa  90.1  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  27.82 
 
 		 1211 aa  90.1  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  27.78 
 
 		 1242 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  27.31 
 
 		 574 aa  89.7  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  23.55 
 
 		 1190 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  22.58 
 
 		 316 aa  89.7  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.32 
 
 		 828 aa  89.7  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00292  transcription initiation factor TFIID subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03070)  28.65 
 
 		 606 aa  88.6  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00299159  normal  0.644069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3829  WD-40 repeat protein  27.91 
 
 		 652 aa  88.6  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0243668  normal  0.0465096 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00940  transcription initiation factor tfiid 90 kda subunit (tafii-90), putative  28.88 
 
 		 813 aa  88.2  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.152566  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.68 
 
 		 1617 aa  87.4  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10391  conserved hypothetical protein  29.23 
 
 		 577 aa  87.4  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.865472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.41 
 
 		 737 aa  87  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  24.15 
 
 		 1348 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>