185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0610 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0610  WD-40 repeat protein  100 
 
 		 349 aa  701    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.520879  normal  0.0413859 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1305  WD-40 repeat-containing protein  51.3 
 
 		 348 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.461181  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3116  WD-40 repeat-containing protein  42.57 
 
 		 335 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2841  hypothetical protein  42.77 
 
 		 324 aa  230  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3020  WD-40 repeat protein  43.49 
 
 		 332 aa  223  6e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2768  WD-40 repeat-containing protein  40.48 
 
 		 329 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0988  WD repeat-containing protein  44.14 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0930  ATP/GTP-binding motif-containing protein  43.79 
 
 		 324 aa  218  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3683  WD-40 repeat protein  40.74 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925722  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2131  WD-40 repeat-containing protein  42.25 
 
 		 343 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0918  WD-40 repeat-containing protein  42.36 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3424  hypothetical protein  42.76 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0709328  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3385  hypothetical protein  41.08 
 
 		 329 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1372  WD repeat-containing protein  40.26 
 
 		 324 aa  209  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.823736  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3798  hypothetical protein  43.43 
 
 		 328 aa  208  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.599459  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0199  WD-40 repeat-containing protein  38.71 
 
 		 340 aa  205  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0246963  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4832  WD-40 repeat-containing protein  42.51 
 
 		 344 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2336  WD-40 repeat-containing protein  42.32 
 
 		 335 aa  203  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173512  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2615  WD-40 repeat protein  42.32 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.023853 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0847  WD-40 repeat-containing protein  42.01 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.135434 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2291  WD-40 repeat protein  42.63 
 
 		 335 aa  200  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4555  WD-40 repeat-containing protein  41.11 
 
 		 339 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.999711  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0930  WD-40 repeat protein  42.16 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1390  WD-40 repeat protein  41.77 
 
 		 337 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0550315  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1343  hypothetical protein  42.59 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808719  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0091  WD-40 repeat-containing protein  42.75 
 
 		 337 aa  186  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0862  WD-40 repeat-containing protein  41.36 
 
 		 337 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0948  WD repeat-containing protein  40.28 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19081  WD-40 repeat-containing G-protein  30.03 
 
 		 358 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.352529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1038  WD-40 repeat-containing protein  31.15 
 
 		 357 aa  135  9e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1045  WD-40 repeat-containing protein  29.83 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  29.26 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15191  WD-40 repeat-containing G-protein  31.85 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  29.55 
 
 		 357 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11281  WD-40 repeat-containing G-protein  30.84 
 
 		 357 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11171  WD-40 repeat-containing G-protein  27.61 
 
 		 357 aa  122  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.194374 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1713  WD-40 repeat-containing protein  25.14 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24.93 
 
 		 1363 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  22.97 
 
 		 1652 aa  75.9  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  24.4 
 
 		 1789 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.83 
 
 		 675 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  27.9 
 
 		 1163 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  26.82 
 
 		 1474 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3190  WD-40 repeat protein  23.56 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  25.98 
 
 		 1364 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  26.44 
 
 		 696 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5186  WD40 domain-containing protein  23.48 
 
 		 346 aa  67  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.21 
 
 		 1481 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.11 
 
 		 1557 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  23.94 
 
 		 1510 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.47 
 
 		 630 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0863  WD-40 repeat protein  24.9 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  25.4 
 
 		 1656 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  27.66 
 
 		 1553 aa  63.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.83 
 
 		 1240 aa  63.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0889  WD-40 repeat protein  24.1 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  29.24 
 
 		 872 aa  63.2  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.11 
 
 		 1686 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.67 
 
 		 1711 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.67 
 
 		 676 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  29.67 
 
 		 1217 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  25.76 
 
 		 1176 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  32.5 
 
 		 1357 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  27.57 
 
 		 947 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  23.34 
 
 		 1330 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  24.17 
 
 		 1193 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  24.4 
 
 		 1714 aa  59.7  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  26.63 
 
 		 687 aa  59.7  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.99 
 
 		 1599 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  27.32 
 
 		 1599 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  25.63 
 
 		 1183 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  23.79 
 
 		 1236 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.08 
 
 		 930 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  27.5 
 
 		 1229 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  22.97 
 
 		 1190 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.87 
 
 		 1760 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0693  WD-40 repeat protein  26.25 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00188435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0674  WD-40 repeat protein  26.25 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  27.63 
 
 		 1211 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  24.85 
 
 		 1807 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.25 
 
 		 698 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  25.24 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1908  WD-40 repeat protein  25.99 
 
 		 365 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  22.88 
 
 		 657 aa  57  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  24.91 
 
 		 565 aa  57  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  34.97 
 
 		 1152 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.33 
 
 		 622 aa  56.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 1221 aa  56.2  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  24.05 
 
 		 464 aa  56.2  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  22.05 
 
 		 1367 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  27.35 
 
 		 1831 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  22.16 
 
 		 1188 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1384  hypothetical protein  25.49 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  24.57 
 
 		 1161 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02590  conserved hypothetical protein  25.22 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  28.48 
 
 		 437 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.21 
 
 		 740 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  25.51 
 
 		 1304 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  26.54 
 
 		 1523 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  24.57 
 
 		 1161 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>