138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3020 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3020  WD-40 repeat protein  100 
 
 		 332 aa  658    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3116  WD-40 repeat-containing protein  62.09 
 
 		 335 aa  437  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2291  WD-40 repeat protein  62.39 
 
 		 335 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2615  WD-40 repeat protein  61.79 
 
 		 335 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.023853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2336  WD-40 repeat-containing protein  61.49 
 
 		 335 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173512  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0091  WD-40 repeat-containing protein  61.09 
 
 		 337 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1390  WD-40 repeat protein  60.48 
 
 		 337 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0550315  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0862  WD-40 repeat-containing protein  61.98 
 
 		 337 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2131  WD-40 repeat-containing protein  48.18 
 
 		 343 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4555  WD-40 repeat-containing protein  48.79 
 
 		 339 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.999711  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4832  WD-40 repeat-containing protein  48.01 
 
 		 344 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0918  WD-40 repeat-containing protein  46.77 
 
 		 337 aa  296  4e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0988  WD repeat-containing protein  49.38 
 
 		 324 aa  295  7e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0930  ATP/GTP-binding motif-containing protein  49.38 
 
 		 324 aa  294  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3424  hypothetical protein  45.54 
 
 		 338 aa  293  4e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0709328  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1343  hypothetical protein  47.27 
 
 		 339 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808719  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1372  WD repeat-containing protein  48.76 
 
 		 324 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.823736  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0847  WD-40 repeat-containing protein  46.53 
 
 		 339 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.135434 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3798  hypothetical protein  47.87 
 
 		 328 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.599459  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2841  hypothetical protein  47.69 
 
 		 324 aa  287  2e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0930  WD-40 repeat protein  48.44 
 
 		 339 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3683  WD-40 repeat protein  47.72 
 
 		 329 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925722  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3385  hypothetical protein  47.72 
 
 		 329 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2768  WD-40 repeat-containing protein  45.57 
 
 		 329 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0610  WD-40 repeat protein  43.49 
 
 		 349 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.520879  normal  0.0413859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0948  WD repeat-containing protein  41.34 
 
 		 340 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1305  WD-40 repeat-containing protein  41.05 
 
 		 348 aa  203  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.461181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0199  WD-40 repeat-containing protein  41.34 
 
 		 340 aa  200  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0246963  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15191  WD-40 repeat-containing G-protein  31.25 
 
 		 345 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1045  WD-40 repeat-containing protein  29.55 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11281  WD-40 repeat-containing G-protein  28.73 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  29.17 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  29.17 
 
 		 357 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11171  WD-40 repeat-containing G-protein  31.07 
 
 		 357 aa  97.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.194374 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1038  WD-40 repeat-containing protein  28.8 
 
 		 357 aa  96.3  7e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19081  WD-40 repeat-containing G-protein  29.08 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.352529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0863  WD-40 repeat protein  28.42 
 
 		 358 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0889  WD-40 repeat protein  28.06 
 
 		 358 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1713  WD-40 repeat-containing protein  28.57 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5186  WD40 domain-containing protein  27.51 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3190  WD-40 repeat protein  26.39 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  28.04 
 
 		 1807 aa  73.9  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0286  WD-40 repeat-containing protein  26.46 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.639022 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  28.66 
 
 		 1304 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1384  hypothetical protein  28.98 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  30.73 
 
 		 1363 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  24.77 
 
 		 1190 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  29.38 
 
 		 1364 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1511  hypothetical protein  28.52 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.338028 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  29.95 
 
 		 1214 aa  57  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1908  WD-40 repeat protein  26.79 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  22.26 
 
 		 1652 aa  56.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.91 
 
 		 740 aa  55.8  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3255  WD-40 repeat-containing protein  26.11 
 
 		 366 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0515461  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  27.74 
 
 		 1344 aa  53.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  27.03 
 
 		 1161 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  22.33 
 
 		 947 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  27.03 
 
 		 1161 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.39 
 
 		 1711 aa  52.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.42 
 
 		 919 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.55 
 
 		 630 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  26.87 
 
 		 1236 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.64 
 
 		 622 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  24.39 
 
 		 1552 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.33 
 
 		 1760 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2789  hypothetical protein  27.99 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.70665  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  24.89 
 
 		 1348 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1263  WD-40 repeat protein  29.71 
 
 		 377 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  27.59 
 
 		 1217 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  26.32 
 
 		 1193 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  25.76 
 
 		 1399 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 1221 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  25.41 
 
 		 1477 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.01 
 
 		 676 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.39 
 
 		 1481 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.43 
 
 		 596 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27 
 
 		 924 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.56 
 
 		 1267 aa  50.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.69 
 
 		 1623 aa  49.7  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  24.74 
 
 		 1831 aa  49.7  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.82 
 
 		 1684 aa  49.7  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.06 
 
 		 682 aa  49.3  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  23.77 
 
 		 1229 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  27.81 
 
 		 464 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  25.38 
 
 		 608 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.1 
 
 		 1163 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.86 
 
 		 865 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  24.37 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.75 
 
 		 675 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  25.14 
 
 		 1789 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  24.12 
 
 		 1523 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2218  WD-40 repeat protein  22.98 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.845961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  23.49 
 
 		 565 aa  47  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4252  WD-40 repeat-containing protein  26.21 
 
 		 1424 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501692  normal  0.871737 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  25.66 
 
 		 564 aa  46.6  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  26.27 
 
 		 742 aa  47  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  24.72 
 
 		 1766 aa  47  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  26.4 
 
 		 1553 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25.59 
 
 		 696 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.38 
 
 		 1686 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>