147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1305 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1305  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 348 aa  699    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.461181  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0610  WD-40 repeat protein  51.3 
 
 		 349 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.520879  normal  0.0413859 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2841  hypothetical protein  45.45 
 
 		 324 aa  225  9e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2131  WD-40 repeat-containing protein  41.19 
 
 		 343 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225533  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0988  WD repeat-containing protein  40.42 
 
 		 324 aa  211  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0930  ATP/GTP-binding motif-containing protein  40.42 
 
 		 324 aa  210  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2768  WD-40 repeat-containing protein  41.78 
 
 		 329 aa  209  8e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3116  WD-40 repeat-containing protein  40.58 
 
 		 335 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1372  WD repeat-containing protein  40.62 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.823736  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3683  WD-40 repeat protein  41.39 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925722  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3385  hypothetical protein  42.38 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3424  hypothetical protein  38.91 
 
 		 338 aa  205  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0709328  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3020  WD-40 repeat protein  41.05 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2291  WD-40 repeat protein  43.63 
 
 		 335 aa  203  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2615  WD-40 repeat protein  43.63 
 
 		 335 aa  202  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.023853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2336  WD-40 repeat-containing protein  43.63 
 
 		 335 aa  202  8e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173512  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0918  WD-40 repeat-containing protein  37.54 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4832  WD-40 repeat-containing protein  41.98 
 
 		 344 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0199  WD-40 repeat-containing protein  41.34 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0246963  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3798  hypothetical protein  41.2 
 
 		 328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.599459  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4555  WD-40 repeat-containing protein  40.49 
 
 		 339 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.999711  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0847  WD-40 repeat-containing protein  38.46 
 
 		 339 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.135434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1343  hypothetical protein  40.37 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808719  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1390  WD-40 repeat protein  41.19 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0550315  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0930  WD-40 repeat protein  38.63 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0091  WD-40 repeat-containing protein  39.51 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0862  WD-40 repeat-containing protein  40.45 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0948  WD repeat-containing protein  39.38 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11281  WD-40 repeat-containing G-protein  31.86 
 
 		 357 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1045  WD-40 repeat-containing protein  31.86 
 
 		 357 aa  135  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  31.55 
 
 		 357 aa  135  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15191  WD-40 repeat-containing G-protein  30.18 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  31.55 
 
 		 357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1038  WD-40 repeat-containing protein  29.1 
 
 		 357 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19081  WD-40 repeat-containing G-protein  31.71 
 
 		 358 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.352529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11171  WD-40 repeat-containing G-protein  27.94 
 
 		 357 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.194374 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1713  WD-40 repeat-containing protein  27.53 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.97 
 
 		 1652 aa  89.7  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  24.85 
 
 		 947 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1908  WD-40 repeat protein  28.09 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  25.58 
 
 		 1510 aa  72  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  22.82 
 
 		 1363 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  23.95 
 
 		 1236 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.56 
 
 		 1481 aa  69.7  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0863  WD-40 repeat protein  24.85 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  23.08 
 
 		 1364 aa  67.8  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5186  WD40 domain-containing protein  23.37 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  26.11 
 
 		 1553 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3190  WD-40 repeat protein  22.91 
 
 		 358 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  26.89 
 
 		 696 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0286  WD-40 repeat-containing protein  24.32 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.639022 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1384  hypothetical protein  27.23 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  26.63 
 
 		 608 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0889  WD-40 repeat protein  24.27 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.14 
 
 		 1163 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.93 
 
 		 740 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.92 
 
 		 1711 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  27.04 
 
 		 1789 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.36 
 
 		 630 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  27.24 
 
 		 1357 aa  60.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  24.02 
 
 		 1831 aa  60.1  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.85 
 
 		 1686 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.13 
 
 		 622 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  23.94 
 
 		 1656 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  23.96 
 
 		 1311 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.63 
 
 		 1599 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  23.27 
 
 		 1523 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.72 
 
 		 676 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.7 
 
 		 1072 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  21.83 
 
 		 1188 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  22.89 
 
 		 1474 aa  56.2  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.8 
 
 		 1072 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3865  WD-40 repeat protein  25.11 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.36 
 
 		 677 aa  56.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.78 
 
 		 943 aa  56.2  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  25.15 
 
 		 1901 aa  55.8  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  25.65 
 
 		 1858 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  28.4 
 
 		 1217 aa  54.7  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3914  WD-40 repeat protein  24.68 
 
 		 366 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.152653  normal  0.245593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  22.78 
 
 		 1661 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  21.66 
 
 		 1552 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  23.33 
 
 		 443 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.76 
 
 		 698 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  24.33 
 
 		 1221 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  22.11 
 
 		 1443 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  23.12 
 
 		 1454 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  25.53 
 
 		 1100 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.22 
 
 		 1760 aa  53.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  23.57 
 
 		 1196 aa  52.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  25.78 
 
 		 335 aa  52.8  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2844  WD-40 repeat-containing protein  30.07 
 
 		 440 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2529  WD-40 repeat protein  33.33 
 
 		 248 aa  52.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00110539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.48 
 
 		 1557 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.72 
 
 		 675 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.76 
 
 		 1240 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.44 
 
 		 1076 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  21.94 
 
 		 464 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  22.96 
 
 		 1190 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  26.2 
 
 		 1211 aa  50.8  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.37 
 
 		 1004 aa  50.4  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>