More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0286 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0286  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 
386 aa  786    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.639022 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5186  WD40 domain-containing protein  73.98 
 
 
346 aa  536  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3190  WD-40 repeat protein  46.8 
 
 
358 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1908  WD-40 repeat protein  48.31 
 
 
365 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0863  WD-40 repeat protein  45.4 
 
 
358 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0889  WD-40 repeat protein  45.13 
 
 
358 aa  295  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  30.5 
 
 
696 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  30.89 
 
 
1364 aa  123  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.64 
 
 
1686 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  26.9 
 
 
1363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  28.61 
 
 
1163 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  28.06 
 
 
1831 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  27.91 
 
 
1652 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.91 
 
 
1760 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  26.18 
 
 
1188 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  26.77 
 
 
1807 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  29.48 
 
 
1789 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  26.8 
 
 
1221 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  29.05 
 
 
344 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  25.4 
 
 
1193 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.62 
 
 
919 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  29.66 
 
 
1714 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.78 
 
 
1262 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  28.42 
 
 
657 aa  103  6e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1713  WD-40 repeat-containing protein  28.08 
 
 
367 aa  103  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.66 
 
 
1481 aa  103  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  29.46 
 
 
1188 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  28.12 
 
 
1236 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  26.02 
 
 
1661 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.69 
 
 
676 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15191  WD-40 repeat-containing G-protein  29.68 
 
 
345 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1038  WD-40 repeat-containing protein  26.8 
 
 
357 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  28.45 
 
 
1217 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  26.89 
 
 
1523 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  27.66 
 
 
344 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  28.18 
 
 
1901 aa  99.8  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2336  WD-40 repeat-containing protein  29.15 
 
 
335 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173512  normal  0.936948 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  26.89 
 
 
1878 aa  99.4  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19081  WD-40 repeat-containing G-protein  27 
 
 
358 aa  99.4  9e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.352529  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.79 
 
 
740 aa  99.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  29.1 
 
 
1443 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  25.92 
 
 
1209 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2615  WD-40 repeat protein  29.15 
 
 
335 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.023853 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  26.19 
 
 
1474 aa  97.4  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  22.74 
 
 
947 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  26.91 
 
 
1656 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0547  WD-40 repeat protein  29.43 
 
 
477 aa  96.3  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  27.11 
 
 
434 aa  95.5  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.62 
 
 
675 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.85 
 
 
677 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.9 
 
 
1711 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.04 
 
 
930 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  28.21 
 
 
1510 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.15 
 
 
622 aa  95.5  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  28.21 
 
 
778 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  25.61 
 
 
1454 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2291  WD-40 repeat protein  29.59 
 
 
335 aa  94  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  27.01 
 
 
1196 aa  93.2  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  28.35 
 
 
1553 aa  93.2  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  25.9 
 
 
1247 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  26.28 
 
 
1161 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.82 
 
 
1599 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.45 
 
 
1609 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1390  WD-40 repeat protein  28.25 
 
 
337 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0550315  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  26.11 
 
 
1348 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  26.92 
 
 
1161 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11171  WD-40 repeat-containing G-protein  27.6 
 
 
357 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.194374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0862  WD-40 repeat-containing protein  29.51 
 
 
337 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13548  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.3 
 
 
1267 aa  91.3  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  25.85 
 
 
1208 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  23.22 
 
 
1858 aa  90.5  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  26.75 
 
 
1599 aa  90.5  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  25.61 
 
 
1766 aa  90.1  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  28.13 
 
 
1190 aa  89.7  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  25.64 
 
 
1177 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  25.07 
 
 
357 aa  88.6  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.34 
 
 
642 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  28.01 
 
 
1357 aa  87.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  24.85 
 
 
1209 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  25.99 
 
 
1213 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  28.38 
 
 
335 aa  87.8  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3581  WD40 domain-containing protein  29.55 
 
 
334 aa  87.4  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2599  WD-40 repeat protein  36.53 
 
 
511 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  29.9 
 
 
443 aa  86.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1045  WD-40 repeat-containing protein  24.51 
 
 
357 aa  86.7  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  27.41 
 
 
1041 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  27.11 
 
 
1399 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.17 
 
 
1004 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  24.79 
 
 
357 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  27.08 
 
 
608 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.71 
 
 
737 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.42 
 
 
1398 aa  85.5  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  24.27 
 
 
924 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.17 
 
 
596 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  29.41 
 
 
565 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  25.14 
 
 
1657 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  28.81 
 
 
346 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  25.3 
 
 
1280 aa  83.6  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.3 
 
 
1557 aa  84  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  24.86 
 
 
1176 aa  83.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>