More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_15191 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_15191  WD-40 repeat-containing G-protein  100 
 
 		 345 aa  701    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1038  WD-40 repeat-containing protein  71.01 
 
 		 357 aa  525  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19081  WD-40 repeat-containing G-protein  70.81 
 
 		 358 aa  519  1e-146  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.352529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11281  WD-40 repeat-containing G-protein  68.41 
 
 		 357 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  66.67 
 
 		 357 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  66.67 
 
 		 357 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1045  WD-40 repeat-containing protein  66.09 
 
 		 357 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11171  WD-40 repeat-containing G-protein  66.09 
 
 		 357 aa  481  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.194374 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1713  WD-40 repeat-containing protein  29.75 
 
 		 367 aa  137  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1305  WD-40 repeat-containing protein  30.18 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.461181  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0610  WD-40 repeat protein  31.85 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.520879  normal  0.0413859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1390  WD-40 repeat protein  32.06 
 
 		 337 aa  122  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0550315  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3116  WD-40 repeat-containing protein  31.6 
 
 		 335 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5186  WD40 domain-containing protein  28.87 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2615  WD-40 repeat protein  30.67 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.023853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2336  WD-40 repeat-containing protein  29.5 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173512  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3020  WD-40 repeat protein  31.25 
 
 		 332 aa  105  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2291  WD-40 repeat protein  29.61 
 
 		 335 aa  102  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0862  WD-40 repeat-containing protein  30.95 
 
 		 337 aa  102  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0199  WD-40 repeat-containing protein  30.19 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0246963  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0918  WD-40 repeat-containing protein  30.04 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0286  WD-40 repeat-containing protein  29.68 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.639022 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2841  hypothetical protein  30.58 
 
 		 324 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0091  WD-40 repeat-containing protein  29.84 
 
 		 337 aa  100  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0930  WD-40 repeat protein  28.93 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3190  WD-40 repeat protein  27.91 
 
 		 358 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0847  WD-40 repeat-containing protein  28.82 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.135434 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25.84 
 
 		 696 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1908  WD-40 repeat protein  27.45 
 
 		 365 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  26.41 
 
 		 1357 aa  94  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2768  WD-40 repeat-containing protein  28.67 
 
 		 329 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  28.53 
 
 		 1217 aa  93.6  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0930  ATP/GTP-binding motif-containing protein  30.45 
 
 		 324 aa  92.8  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0988  WD repeat-containing protein  30.45 
 
 		 324 aa  92.8  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3424  hypothetical protein  29.39 
 
 		 338 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0709328  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4555  WD-40 repeat-containing protein  28.26 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.999711  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  25.56 
 
 		 1789 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1372  WD repeat-containing protein  31.06 
 
 		 324 aa  90.5  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.823736  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.31 
 
 		 1652 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.92 
 
 		 1760 aa  90.1  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.13 
 
 		 919 aa  89.7  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2131  WD-40 repeat-containing protein  29.71 
 
 		 343 aa  89.4  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  27.8 
 
 		 1236 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  26.53 
 
 		 434 aa  87.8  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  26.4 
 
 		 1364 aa  88.6  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  24.76 
 
 		 1247 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0863  WD-40 repeat protein  27.55 
 
 		 358 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1343  hypothetical protein  28 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808719  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  23.8 
 
 		 1363 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  25.51 
 
 		 947 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0948  WD repeat-containing protein  28.21 
 
 		 340 aa  87  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  25.94 
 
 		 1100 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0889  WD-40 repeat protein  27.21 
 
 		 358 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4832  WD-40 repeat-containing protein  31.05 
 
 		 344 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  29.77 
 
 		 675 aa  86.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  27.65 
 
 		 1163 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  23.16 
 
 		 1510 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 1221 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  26.44 
 
 		 1766 aa  84  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  24.05 
 
 		 1188 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3683  WD-40 repeat protein  28.28 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925722  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.04 
 
 		 740 aa  83.2  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  27.3 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.29 
 
 		 1686 aa  82.8  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  25.93 
 
 		 1807 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.15 
 
 		 642 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.11 
 
 		 1481 aa  82.4  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  25.43 
 
 		 1041 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.09 
 
 		 1039 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3385  hypothetical protein  28.28 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  29.65 
 
 		 1373 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  22.38 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  26.69 
 
 		 1901 aa  80.1  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  25.25 
 
 		 1304 aa  80.1  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  26.23 
 
 		 1858 aa  80.1  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.51 
 
 		 1711 aa  79.7  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  23.78 
 
 		 1552 aa  79.3  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  25.59 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  24.84 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  27.53 
 
 		 1344 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  23.96 
 
 		 1831 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3798  hypothetical protein  29.96 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.599459  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  25.62 
 
 		 1661 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  24.05 
 
 		 1193 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  24.77 
 
 		 1523 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.69 
 
 		 1557 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  25.48 
 
 		 1209 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  26.94 
 
 		 1188 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.95 
 
 		 630 aa  76.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  24.56 
 
 		 1213 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.64 
 
 		 1262 aa  76.3  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.38 
 
 		 1599 aa  76.3  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  24.08 
 
 		 1411 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.61 
 
 		 622 aa  75.9  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  30.51 
 
 		 1334 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.52 
 
 		 1856 aa  75.5  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  23.31 
 
 		 1161 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  23.31 
 
 		 1161 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0693  WD-40 repeat protein  26.36 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00188435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  27.02 
 
 		 1190 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>