149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1372 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1372  WD repeat-containing protein  100 
 
 
324 aa  659    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.823736  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0988  WD repeat-containing protein  87.65 
 
 
324 aa  592  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0930  ATP/GTP-binding motif-containing protein  87.35 
 
 
324 aa  590  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2841  hypothetical protein  68.11 
 
 
324 aa  465  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3683  WD-40 repeat protein  63.11 
 
 
329 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925722  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2768  WD-40 repeat-containing protein  64.33 
 
 
329 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3385  hypothetical protein  62.2 
 
 
329 aa  433  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3798  hypothetical protein  62.39 
 
 
328 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.599459  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3020  WD-40 repeat protein  48.76 
 
 
332 aa  290  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2291  WD-40 repeat protein  47.69 
 
 
335 aa  280  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2131  WD-40 repeat-containing protein  44.06 
 
 
343 aa  276  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225533  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4555  WD-40 repeat-containing protein  47.49 
 
 
339 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.999711  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2615  WD-40 repeat protein  46.46 
 
 
335 aa  270  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.023853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2336  WD-40 repeat-containing protein  46.15 
 
 
335 aa  269  4e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173512  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3116  WD-40 repeat-containing protein  43.73 
 
 
335 aa  269  5e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4832  WD-40 repeat-containing protein  43.65 
 
 
344 aa  269  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224908  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3424  hypothetical protein  47.14 
 
 
338 aa  265  7e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0709328  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0918  WD-40 repeat-containing protein  47.5 
 
 
337 aa  265  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1343  hypothetical protein  47.37 
 
 
339 aa  262  8e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808719  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0091  WD-40 repeat-containing protein  44.79 
 
 
337 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0930  WD-40 repeat protein  43.65 
 
 
339 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0847  WD-40 repeat-containing protein  43.69 
 
 
339 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.135434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1390  WD-40 repeat protein  47.23 
 
 
337 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0550315  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0862  WD-40 repeat-containing protein  47.85 
 
 
337 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13548  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0610  WD-40 repeat protein  40.26 
 
 
349 aa  209  6e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.520879  normal  0.0413859 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1305  WD-40 repeat-containing protein  40.62 
 
 
348 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.461181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0199  WD-40 repeat-containing protein  42.12 
 
 
340 aa  205  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0246963  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0948  WD repeat-containing protein  38.93 
 
 
340 aa  179  7e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11281  WD-40 repeat-containing G-protein  27.38 
 
 
357 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19081  WD-40 repeat-containing G-protein  30.21 
 
 
358 aa  95.9  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.352529  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1045  WD-40 repeat-containing protein  28.63 
 
 
357 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1038  WD-40 repeat-containing protein  28.91 
 
 
357 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  28.63 
 
 
357 aa  93.6  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  28.63 
 
 
357 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15191  WD-40 repeat-containing G-protein  31.06 
 
 
345 aa  90.5  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11171  WD-40 repeat-containing G-protein  27.88 
 
 
357 aa  84.7  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.194374 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1384  hypothetical protein  30.66 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  27.37 
 
 
1190 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1713  WD-40 repeat-containing protein  25.87 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3190  WD-40 repeat protein  25.08 
 
 
358 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.21 
 
 
1686 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  25 
 
 
1348 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  26.06 
 
 
1789 aa  65.1  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0863  WD-40 repeat protein  24.74 
 
 
358 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0889  WD-40 repeat protein  24.74 
 
 
358 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5186  WD40 domain-containing protein  24.84 
 
 
346 aa  63.5  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  28.32 
 
 
1766 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  25.82 
 
 
1304 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  26.9 
 
 
1477 aa  59.7  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.53 
 
 
1481 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  24.87 
 
 
1858 aa  58.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  25.44 
 
 
1214 aa  58.9  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  23.87 
 
 
1161 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  23.87 
 
 
1161 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.46 
 
 
1267 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  24.43 
 
 
1661 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  24.65 
 
 
1229 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  27.18 
 
 
1553 aa  56.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24.73 
 
 
1363 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  23.51 
 
 
947 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.52 
 
 
1547 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  23.65 
 
 
1164 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.57 
 
 
833 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  24.63 
 
 
1364 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0286  WD-40 repeat-containing protein  24.92 
 
 
386 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.639022 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  25.59 
 
 
1209 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.1 
 
 
919 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.29 
 
 
1609 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  24.89 
 
 
1599 aa  53.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  22.91 
 
 
1163 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  21.83 
 
 
1552 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  23.44 
 
 
1367 aa  52  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.12 
 
 
1760 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  28 
 
 
1510 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.27 
 
 
865 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.66 
 
 
1856 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.1 
 
 
1652 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  27.11 
 
 
924 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.16 
 
 
1599 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  22.51 
 
 
1714 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  26.34 
 
 
565 aa  50.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  29.23 
 
 
1217 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  25.37 
 
 
1100 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.82 
 
 
740 aa  50.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.34 
 
 
1711 aa  49.7  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  25.12 
 
 
1656 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  25.08 
 
 
1236 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.14 
 
 
1240 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6487  WD-40 repeat-containing protein  28.65 
 
 
780 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.177218 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  29.51 
 
 
1177 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  23.08 
 
 
346 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1908  WD-40 repeat protein  23.83 
 
 
365 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2013  serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 
676 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00454469  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.04 
 
 
1072 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  24.68 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.04 
 
 
1072 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.24 
 
 
1262 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  23.57 
 
 
1330 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4252  WD-40 repeat-containing protein  24.85 
 
 
1424 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501692  normal  0.871737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  27.72 
 
 
1901 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>