173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0918 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0918  WD-40 repeat-containing protein  100 
 
 		 337 aa  681    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3424  hypothetical protein  88.02 
 
 		 338 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0709328  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4555  WD-40 repeat-containing protein  67.76 
 
 		 339 aa  484  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.999711  normal  0.705605 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0847  WD-40 repeat-containing protein  66.57 
 
 		 339 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.135434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1343  hypothetical protein  65.37 
 
 		 339 aa  467  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808719  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0930  WD-40 repeat protein  64.94 
 
 		 339 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4832  WD-40 repeat-containing protein  64.48 
 
 		 344 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2131  WD-40 repeat-containing protein  55.18 
 
 		 343 aa  353  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0862  WD-40 repeat-containing protein  51.1 
 
 		 337 aa  309  5e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3116  WD-40 repeat-containing protein  48.16 
 
 		 335 aa  308  5.9999999999999995e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1390  WD-40 repeat protein  48.64 
 
 		 337 aa  308  8e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0550315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2291  WD-40 repeat protein  48.78 
 
 		 335 aa  300  3e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal  0.504571 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3020  WD-40 repeat protein  46.77 
 
 		 332 aa  296  4e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2615  WD-40 repeat protein  48.17 
 
 		 335 aa  295  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.023853 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2336  WD-40 repeat-containing protein  48.17 
 
 		 335 aa  294  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173512  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0091  WD-40 repeat-containing protein  48.01 
 
 		 337 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2841  hypothetical protein  48.79 
 
 		 324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0988  WD repeat-containing protein  49.65 
 
 		 324 aa  278  7e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0930  ATP/GTP-binding motif-containing protein  49.65 
 
 		 324 aa  278  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3385  hypothetical protein  45.12 
 
 		 329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3683  WD-40 repeat protein  44.82 
 
 		 329 aa  269  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925722  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2768  WD-40 repeat-containing protein  45.43 
 
 		 329 aa  269  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3798  hypothetical protein  44.34 
 
 		 328 aa  266  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.599459  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1372  WD repeat-containing protein  47.5 
 
 		 324 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.823736  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0610  WD-40 repeat protein  42.36 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.520879  normal  0.0413859 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1305  WD-40 repeat-containing protein  37.54 
 
 		 348 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.461181  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0199  WD-40 repeat-containing protein  41.39 
 
 		 340 aa  196  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0246963  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0948  WD repeat-containing protein  37.97 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1045  WD-40 repeat-containing protein  30.29 
 
 		 357 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1038  WD-40 repeat-containing protein  30.82 
 
 		 357 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  29.93 
 
 		 357 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19081  WD-40 repeat-containing G-protein  31.07 
 
 		 358 aa  106  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.352529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11361  WD-40 repeat-containing G-protein  29.93 
 
 		 357 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11281  WD-40 repeat-containing G-protein  29.41 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15191  WD-40 repeat-containing G-protein  30.04 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3190  WD-40 repeat protein  29.5 
 
 		 358 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11171  WD-40 repeat-containing G-protein  29.46 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.194374 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1713  WD-40 repeat-containing protein  25.43 
 
 		 367 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  27.67 
 
 		 1807 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1908  WD-40 repeat protein  26.84 
 
 		 365 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0863  WD-40 repeat protein  26.06 
 
 		 358 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  23.6 
 
 		 947 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0889  WD-40 repeat protein  25.73 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.711762  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5186  WD40 domain-containing protein  26.44 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  26.27 
 
 		 1858 aa  73.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  27.41 
 
 		 1348 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1384  hypothetical protein  26.67 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  25.66 
 
 		 1789 aa  69.3  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  30.89 
 
 		 1477 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.87 
 
 		 1481 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0286  WD-40 repeat-containing protein  24.43 
 
 		 386 aa  66.2  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.639022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.28 
 
 		 1163 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  25.08 
 
 		 1510 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.37 
 
 		 740 aa  62.8  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.2 
 
 		 943 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  24.01 
 
 		 1161 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.43 
 
 		 622 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  24.01 
 
 		 1552 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  23.73 
 
 		 1161 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  23.91 
 
 		 1247 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  21.38 
 
 		 1363 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  27.21 
 
 		 1553 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  24.07 
 
 		 1831 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  27.32 
 
 		 1304 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  30.4 
 
 		 1217 aa  60.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  25.79 
 
 		 1766 aa  60.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  23.57 
 
 		 1661 aa  60.1  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2844  WD-40 repeat-containing protein  29.52 
 
 		 440 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  23.47 
 
 		 1190 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3070  WD-40 repeat protein  28.41 
 
 		 438 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  25.56 
 
 		 1364 aa  59.3  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1511  hypothetical protein  27.94 
 
 		 361 aa  59.3  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.338028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.59 
 
 		 1686 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.7 
 
 		 833 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  24.07 
 
 		 696 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  23.18 
 
 		 505 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.79 
 
 		 924 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  25.72 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.96 
 
 		 1599 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  22.22 
 
 		 1209 aa  56.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  23.94 
 
 		 1164 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.63 
 
 		 676 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  24.84 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  25.97 
 
 		 742 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2789  hypothetical protein  27.57 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.70665  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.69 
 
 		 1267 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  24.86 
 
 		 790 aa  54.3  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.38 
 
 		 1652 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  24.35 
 
 		 1236 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  27.37 
 
 		 1209 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.37 
 
 		 865 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 1221 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  25.76 
 
 		 1367 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.76 
 
 		 642 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0322  WD-40 repeat-containing protein  25.18 
 
 		 872 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  29.33 
 
 		 1344 aa  52  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  26.28 
 
 		 1214 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.71 
 
 		 1609 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  23.97 
 
 		 1196 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  22.81 
 
 		 1714 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>