23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2789 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2789  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  690    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.70665  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1511  hypothetical protein  95.01 
 
 		 361 aa  630  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.338028 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1384  hypothetical protein  36.76 
 
 		 376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0948  WD repeat-containing protein  31.06 
 
 		 340 aa  86.3  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2768  WD-40 repeat-containing protein  28.57 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2615  WD-40 repeat protein  30.63 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.023853 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3116  WD-40 repeat-containing protein  27.82 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.616102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2336  WD-40 repeat-containing protein  30.63 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173512  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1390  WD-40 repeat protein  29.17 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0550315  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0862  WD-40 repeat-containing protein  31.27 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0918  WD-40 repeat-containing protein  27.57 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.461378  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3385  hypothetical protein  24.63 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.673193  normal  0.250549 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3424  hypothetical protein  27.94 
 
 		 338 aa  53.9  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0709328  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3683  WD-40 repeat protein  24.63 
 
 		 329 aa  53.1  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.925722  normal  0.278325 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1343  hypothetical protein  27.37 
 
 		 339 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.808719  normal  0.358123 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2841  hypothetical protein  27.51 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3020  WD-40 repeat protein  28.01 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1305  WD-40 repeat-containing protein  31.34 
 
 		 348 aa  49.7  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.461181  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0610  WD-40 repeat protein  26.28 
 
 		 349 aa  49.3  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.520879  normal  0.0413859 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.16 
 
 		 943 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  25.26 
 
 		 1454 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4832  WD-40 repeat-containing protein  30 
 
 		 344 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.62 
 
 		 677 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>