30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4046 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7435  hypothetical protein  100 
 
 		 624 aa  1297    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4046  hypothetical protein  100 
 
 		 624 aa  1297    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00161846  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1140  hypothetical protein  37.37 
 
 		 294 aa  187  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5078  hypothetical protein  34.77 
 
 		 809 aa  181  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126059  normal  0.0204601 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1434  hypothetical protein  40.99 
 
 		 772 aa  180  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.709183  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3053  hypothetical protein  29.1 
 
 		 643 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0409  hypothetical protein  28.05 
 
 		 519 aa  77  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  25.94 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  25.56 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  27.43 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  29.05 
 
 		 463 aa  59.7  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  25.56 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  26.76 
 
 		 1682 aa  55.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  24.78 
 
 		 432 aa  54.7  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  26.92 
 
 		 324 aa  54.3  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  25.09 
 
 		 431 aa  53.9  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.83 
 
 		 1383 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  28.48 
 
 		 484 aa  50.8  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  24.72 
 
 		 653 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  22.7 
 
 		 687 aa  49.3  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0744  copper amine oxidase-like protein  20.74 
 
 		 950 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0284695  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  26.8 
 
 		 486 aa  48.5  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  27.88 
 
 		 440 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  32.2 
 
 		 795 aa  47.4  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0634  serine/threonine protein kinase  23.02 
 
 		 695 aa  45.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.171322  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  28.81 
 
 		 352 aa  45.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  22.51 
 
 		 652 aa  45.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  24.46 
 
 		 423 aa  44.3  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  27.7 
 
 		 475 aa  44.3  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  28.42 
 
 		 963 aa  43.9  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>